More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04760 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  100 
 
 		 573 aa  1180    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  47.29 
 
 		 354 aa  313  6.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01940  predicted xylanase/chitin deacetylase  37.19 
 
 		 571 aa  299  9e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000016994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  32.63 
 
 		 440 aa  176  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  45.59 
 
 		 251 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  40.57 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  41.06 
 
 		 302 aa  154  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  39.59 
 
 		 285 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  40.09 
 
 		 277 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  39.02 
 
 		 317 aa  140  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 220 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  39.22 
 
 		 241 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  39.51 
 
 		 213 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  39.51 
 
 		 213 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  39.51 
 
 		 213 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  39.51 
 
 		 241 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  39.51 
 
 		 213 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  39.51 
 
 		 241 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  38.73 
 
 		 241 aa  133  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  37.62 
 
 		 244 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  37.7 
 
 		 259 aa  131  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 		 321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  38.54 
 
 		 244 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  38.66 
 
 		 283 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  38.05 
 
 		 217 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 		 204 aa  125  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0141  polysaccharide deacetylase  34.9 
 
 		 216 aa  122  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  36.45 
 
 		 353 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  36.68 
 
 		 320 aa  121  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  35.86 
 
 		 413 aa  121  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  38.35 
 
 		 244 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  37.44 
 
 		 307 aa  121  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  36.76 
 
 		 221 aa  120  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  37.07 
 
 		 247 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  37.56 
 
 		 468 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  37.2 
 
 		 1099 aa  118  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  36.95 
 
 		 264 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  38.35 
 
 		 752 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  33.99 
 
 		 273 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  34.6 
 
 		 1124 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 240 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 247 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  37.38 
 
 		 488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  33.33 
 
 		 279 aa  113  7.000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  34.15 
 
 		 267 aa  113  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1185  polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 		 236 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 217 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 		 229 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 		 372 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  34.45 
 
 		 522 aa  110  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  32.24 
 
 		 215 aa  109  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  35.86 
 
 		 405 aa  108  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  34.85 
 
 		 275 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  30.97 
 
 		 1115 aa  108  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.97 
 
 		 1115 aa  108  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  30.97 
 
 		 1119 aa  108  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.46 
 
 		 1115 aa  108  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  28.25 
 
 		 1154 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  30.97 
 
 		 927 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  32.52 
 
 		 250 aa  107  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.34 
 
 		 1115 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  34.34 
 
 		 275 aa  107  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 317 aa  107  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  33 
 
 		 287 aa  107  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  36.18 
 
 		 242 aa  106  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  33.96 
 
 		 299 aa  107  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  35.5 
 
 		 465 aa  106  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  32.67 
 
 		 522 aa  106  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  36.36 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  34.68 
 
 		 368 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  32.69 
 
 		 212 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  31.5 
 
 		 258 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  33.84 
 
 		 275 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  30.5 
 
 		 258 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  33.64 
 
 		 1120 aa  105  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1515  polysaccharide deacetylase  31.79 
 
 		 222 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.416831  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  33.84 
 
 		 275 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  33.84 
 
 		 275 aa  105  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  33.84 
 
 		 275 aa  105  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  33.84 
 
 		 275 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  37.81 
 
 		 273 aa  105  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  33.96 
 
 		 301 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  38.76 
 
 		 273 aa  104  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  33.64 
 
 		 387 aa  104  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  30.5 
 
 		 261 aa  104  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  33.66 
 
 		 275 aa  104  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  35.35 
 
 		 503 aa  103  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  30.6 
 
 		 872 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  38.76 
 
 		 273 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  34.34 
 
 		 291 aa  103  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  32.51 
 
 		 244 aa  103  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  34.34 
 
 		 276 aa  103  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  33.66 
 
 		 234 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 264 aa  103  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  38.16 
 
 		 273 aa  103  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  29.06 
 
 		 224 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3360  polysaccharide deacetylase  32.23 
 
 		 202 aa  103  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0110446 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  30.88 
 
 		 219 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  32.66 
 
 		 683 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  32.59 
 
 		 251 aa  102  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>