More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1762 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
243 aa  502  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  43.78 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  37.07 
 
 
259 aa  161  8.000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  39.53 
 
 
258 aa  154  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  36.96 
 
 
258 aa  154  9e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  32.38 
 
 
256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  38.67 
 
 
413 aa  129  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  37.64 
 
 
392 aa  121  9e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  36.6 
 
 
405 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  36 
 
 
468 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  36.93 
 
 
417 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  32.34 
 
 
481 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  37.02 
 
 
246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02423  acetylxylan esterase  36.68 
 
 
260 aa  112  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1834  polysaccharide deacetylase  33.82 
 
 
397 aa  112  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  35.83 
 
 
349 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 
387 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0661  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  36.76 
 
 
244 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 
264 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01375  polysaccharide deacetylase  36.13 
 
 
218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  32.39 
 
 
292 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 
256 aa  109  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  36.52 
 
 
221 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  35.56 
 
 
251 aa  108  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  34.07 
 
 
264 aa  108  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  34.83 
 
 
373 aa  108  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 
368 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  29.71 
 
 
344 aa  107  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0408  peptidoglycan GlcNAc deacetylase  35.23 
 
 
240 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  35.42 
 
 
537 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  37.85 
 
 
307 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  34 
 
 
275 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  33.66 
 
 
479 aa  106  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  33.71 
 
 
267 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  34.03 
 
 
272 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
275 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  33.51 
 
 
275 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  33.51 
 
 
275 aa  105  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
275 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
275 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
275 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  30.77 
 
 
364 aa  105  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  30.73 
 
 
273 aa  105  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  33.51 
 
 
275 aa  105  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  34.97 
 
 
275 aa  104  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 
479 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  34.5 
 
 
275 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  34.97 
 
 
275 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 
275 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 
275 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 
275 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2294  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 
260 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923024  unclonable  2.97243e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 
275 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  30.99 
 
 
283 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 
277 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 
275 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  38.85 
 
 
425 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  36.99 
 
 
237 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 
273 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  37.1 
 
 
262 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 
273 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 
273 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 
273 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 
273 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 
199 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 
275 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 
273 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 
276 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
273 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  32.96 
 
 
321 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  32.22 
 
 
263 aa  102  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 
275 aa  102  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  32.22 
 
 
324 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  35 
 
 
320 aa  102  5e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 
273 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 
305 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
465 aa  102  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  34.03 
 
 
273 aa  102  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  33.33 
 
 
273 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2175  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  34.24 
 
 
221 aa  102  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 
275 aa  101  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 
275 aa  101  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  35.08 
 
 
752 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1625  polysaccharide deacetylase  31.07 
 
 
212 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679944  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 
372 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  32.96 
 
 
287 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2736  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 
275 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000182255  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  35.39 
 
 
302 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 
289 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2145  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
201 aa  100  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  31.69 
 
 
291 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  29.82 
 
 
244 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
273 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  30.9 
 
 
255 aa  99.4  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5477  polysaccharide deacetylase  35.09 
 
 
206 aa  99.4  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947661  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
294 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
244 aa  99.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  32.58 
 
 
273 aa  99  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  34.64 
 
 
272 aa  99.4  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>