More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1625 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1625  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
212 aa  433  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679944  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01375  polysaccharide deacetylase  50.48 
 
 
218 aa  214  9e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0661  polysaccharide deacetylase  46.67 
 
 
205 aa  211  7e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5477  polysaccharide deacetylase  47.98 
 
 
206 aa  207  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947661  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2237  polysaccharide deacetylase  43.81 
 
 
215 aa  206  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0244  polysaccharide deacetylase  45.02 
 
 
208 aa  193  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2175  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  41.89 
 
 
221 aa  187  8e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_002950  PG2145  polysaccharide deacetylase  40.61 
 
 
201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  37.37 
 
 
241 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 
220 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  36.32 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 
213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  37.76 
 
 
255 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  37.11 
 
 
241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  35.79 
 
 
213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  35.79 
 
 
213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  35.79 
 
 
213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  35.79 
 
 
241 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 
261 aa  122  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  32.14 
 
 
251 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
277 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  34.85 
 
 
259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 
264 aa  111  9e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  31.72 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 
522 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 
267 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 
405 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  32.52 
 
 
258 aa  106  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
221 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 
256 aa  105  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  32.45 
 
 
305 aa  105  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  30.98 
 
 
244 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  33.69 
 
 
279 aa  105  6e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 
413 aa  104  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 
302 aa  105  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1185  polysaccharide deacetylase  30.27 
 
 
409 aa  104  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  35.71 
 
 
234 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  31.38 
 
 
247 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  28.73 
 
 
317 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  31.15 
 
 
229 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1579  polysaccharide deacetylase  26.39 
 
 
251 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 
275 aa  102  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  29.83 
 
 
468 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  33.69 
 
 
368 aa  102  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  28.34 
 
 
465 aa  102  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 
276 aa  101  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  31.07 
 
 
243 aa  101  8e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 
258 aa  101  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 
275 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 
275 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 
275 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  36.22 
 
 
234 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 
275 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 
275 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 
275 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  34.69 
 
 
234 aa  99.8  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0950  polysaccharide deacetylase  34.45 
 
 
331 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.942837  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
372 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  31.75 
 
 
286 aa  99.8  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 
234 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1702  polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 
234 aa  99  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1836  polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 
234 aa  99  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1880  putative polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 
234 aa  99  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 
275 aa  99  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  30.77 
 
 
275 aa  99  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4792  putative polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 
269 aa  99  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  25.97 
 
 
252 aa  99  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  28.16 
 
 
417 aa  98.6  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1978  polysaccharide deacetylase  27.59 
 
 
229 aa  98.2  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 
404 aa  98.2  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 
321 aa  98.2  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 
234 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  33.67 
 
 
234 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  28.18 
 
 
247 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  34.52 
 
 
273 aa  97.1  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
234 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  31.67 
 
 
387 aa  96.3  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  33.12 
 
 
240 aa  95.9  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  28.35 
 
 
413 aa  95.9  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  27.05 
 
 
240 aa  95.5  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  35.03 
 
 
273 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  26.74 
 
 
204 aa  94.7  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1728  polysaccharide deacetylase family protein  31.34 
 
 
238 aa  94.7  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000179283  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  34.52 
 
 
273 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  34.52 
 
 
273 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  34.52 
 
 
273 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3747  polysaccharide deacetylase  32.24 
 
 
245 aa  94  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000014318  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  34.52 
 
 
273 aa  94  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  34.01 
 
 
273 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  34.52 
 
 
273 aa  94  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  34.52 
 
 
273 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  34.52 
 
 
273 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  25.27 
 
 
430 aa  94.4  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  29.83 
 
 
425 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  29.61 
 
 
503 aa  93.6  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 
294 aa  93.6  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  30.34 
 
 
292 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 
273 aa  93.2  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>