More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2145 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2145  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 201 aa  421  1e-117  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2237  polysaccharide deacetylase  41.21 
 
 		 215 aa  184  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0661  polysaccharide deacetylase  43.43 
 
 		 205 aa  184  8e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01375  polysaccharide deacetylase  42.23 
 
 		 218 aa  183  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5477  polysaccharide deacetylase  42.13 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1625  polysaccharide deacetylase  40.61 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679944  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2175  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  39.05 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0244  polysaccharide deacetylase  40.61 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 		 264 aa  124  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  34.09 
 
 		 289 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  36.18 
 
 		 305 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  32.63 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 		 221 aa  104  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  35.33 
 
 		 349 aa  104  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  35.33 
 
 		 246 aa  104  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  35.88 
 
 		 289 aa  102  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  38.59 
 
 		 272 aa  101  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  32.04 
 
 		 277 aa  101  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1515  polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 		 222 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.416831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  30.16 
 
 		 373 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 302 aa  99.8  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.66 
 
 		 251 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 		 425 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  34.59 
 
 		 503 aa  97.1  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  33.77 
 
 		 275 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  30.73 
 
 		 241 aa  96.3  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  36.77 
 
 		 413 aa  96.3  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  32.69 
 
 		 240 aa  96.3  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  33.33 
 
 		 373 aa  95.9  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  30.46 
 
 		 241 aa  95.1  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  29.9 
 
 		 220 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  33.55 
 
 		 275 aa  94.7  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 		 300 aa  95.1  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  33.55 
 
 		 275 aa  94.7  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  33.55 
 
 		 275 aa  94.7  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  33.55 
 
 		 275 aa  94.7  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 372 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  32.9 
 
 		 276 aa  94  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  36.13 
 
 		 275 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  33.55 
 
 		 275 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  33.55 
 
 		 275 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  33.12 
 
 		 275 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  35.33 
 
 		 267 aa  92.8  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 		 405 aa  92.8  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  31.46 
 
 		 344 aa  92.8  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 		 286 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 		 258 aa  92.8  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 		 294 aa  92.4  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  32.04 
 
 		 229 aa  92.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1551  polysaccharide deacetylase  37.66 
 
 		 243 aa  92.4  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  30.93 
 
 		 258 aa  92.4  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  31.47 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  29.67 
 
 		 321 aa  92.4  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  29.26 
 
 		 247 aa  92.4  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  28.43 
 
 		 213 aa  92  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  28.43 
 
 		 213 aa  92  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  28.43 
 
 		 213 aa  92  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  28.92 
 
 		 241 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  28.43 
 
 		 213 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 		 300 aa  91.3  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  30.15 
 
 		 244 aa  91.3  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1978  polysaccharide deacetylase  31.71 
 
 		 229 aa  91.3  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  32.32 
 
 		 287 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1185  polysaccharide deacetylase  31.89 
 
 		 409 aa  90.9  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  29.38 
 
 		 368 aa  90.9  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 		 287 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  37.66 
 
 		 287 aa  89.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 		 264 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  30.5 
 
 		 372 aa  90.5  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  30.65 
 
 		 244 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1081  polysaccharide deacetylase  32.48 
 
 		 242 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  30.15 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 		 479 aa  89.4  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  34.84 
 
 		 392 aa  89.4  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  28.11 
 
 		 291 aa  89  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  32.8 
 
 		 479 aa  88.6  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  36.31 
 
 		 235 aa  88.6  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  30.2 
 
 		 273 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1185  polysaccharide deacetylase  30.54 
 
 		 236 aa  87.8  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0920  polysaccharide deacetylase family protein  33.97 
 
 		 270 aa  87  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  29.1 
 
 		 387 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  31.18 
 
 		 465 aa  87.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1912  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 		 232 aa  86.7  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  29.21 
 
 		 286 aa  86.7  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  35.67 
 
 		 283 aa  87  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  31.71 
 
 		 294 aa  87  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  29.81 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  37.25 
 
 		 294 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  37.25 
 
 		 294 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 		 465 aa  85.9  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  30.35 
 
 		 1115 aa  85.9  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  30.35 
 
 		 1119 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  32.94 
 
 		 212 aa  85.9  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  28.42 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.35 
 
 		 1115 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 		 301 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  32.5 
 
 		 320 aa  86.3  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>