More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03855 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  100 
 
 
258 aa  526  1e-148  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  44.59 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  39.91 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  38.24 
 
 
258 aa  161  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  36.96 
 
 
243 aa  154  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  37.76 
 
 
256 aa  143  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3369  polysaccharide deacetylase  33 
 
 
259 aa  135  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792887  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  36.49 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4179  polysaccharide deacetylase  37.43 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  36.97 
 
 
275 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  36.49 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  33.49 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 
275 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 
275 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 
275 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.16 
 
 
251 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 
256 aa  126  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  35.11 
 
 
404 aa  125  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  37.33 
 
 
234 aa  125  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  35.55 
 
 
276 aa  125  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  33.94 
 
 
289 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  35.55 
 
 
275 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  32.12 
 
 
240 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3983  polysaccharide deacetylase  32.88 
 
 
284 aa  122  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  38.5 
 
 
234 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  34.41 
 
 
292 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  34.43 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 
520 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  34.93 
 
 
234 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0951  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 
409 aa  121  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0651013  normal  0.44667 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  34.21 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 
321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  35.35 
 
 
244 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1702  polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 
234 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1836  polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 
234 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1880  putative polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 
234 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  33.16 
 
 
279 aa  119  6e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  32.9 
 
 
258 aa  119  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  32.26 
 
 
283 aa  118  9e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  36.28 
 
 
234 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  36.28 
 
 
234 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  31.22 
 
 
349 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  31.22 
 
 
246 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  35.14 
 
 
275 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  34.41 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 
465 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  34.59 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2571  polysaccharide deacetylase  39.61 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  35.82 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  35.83 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  36.45 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  36.45 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  31.1 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  30.29 
 
 
287 aa  116  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  31.1 
 
 
287 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  34.9 
 
 
247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  33.33 
 
 
234 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 
213 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  33.7 
 
 
417 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0920  polysaccharide deacetylase family protein  33.86 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  35.35 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  29.89 
 
 
324 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  35.47 
 
 
241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  35.47 
 
 
213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  35.47 
 
 
213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  32.58 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  35.47 
 
 
213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02423  acetylxylan esterase  32.2 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 
430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  31.38 
 
 
320 aa  113  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  35.35 
 
 
217 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  30.93 
 
 
300 aa  113  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  31.72 
 
 
259 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 
372 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 
368 aa  112  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  31.32 
 
 
413 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  32.32 
 
 
204 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  29.9 
 
 
291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  35.64 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  33.33 
 
 
373 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  33.15 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  30.5 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  30.5 
 
 
294 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  28.39 
 
 
481 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  29.8 
 
 
305 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  31.72 
 
 
387 aa  109  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  25.58 
 
 
285 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  34.42 
 
 
280 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  29.59 
 
 
263 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 
286 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  29.27 
 
 
479 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  29.38 
 
 
413 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  27.97 
 
 
479 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  32.71 
 
 
752 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  30.95 
 
 
440 aa  106  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 
522 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1625  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 
212 aa  106  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>