More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2113 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  100 
 
 		 259 aa  535  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  39.91 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  41.15 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 258 aa  168  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  37.07 
 
 		 243 aa  161  9e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  40.39 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  37.57 
 
 		 246 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  36.87 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  37.57 
 
 		 349 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  37.29 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  30.67 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3983  polysaccharide deacetylase  34.9 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  32.58 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  37.89 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  34.32 
 
 		 289 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 		 413 aa  123  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4179  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 266 aa  121  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  34.05 
 
 		 287 aa  121  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  31.39 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  32.97 
 
 		 430 aa  119  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  32.17 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 		 300 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3369  polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792887  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  35.98 
 
 		 287 aa  116  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0920  polysaccharide deacetylase family protein  36.09 
 
 		 270 aa  115  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  31.89 
 
 		 297 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  31.35 
 
 		 468 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  33.84 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  29.7 
 
 		 404 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  35.59 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2215  putative transmembrane protein  31.65 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  33.14 
 
 		 240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1625  polysaccharide deacetylase  34.85 
 
 		 212 aa  113  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679944  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0244  polysaccharide deacetylase  38.41 
 
 		 208 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02423  acetylxylan esterase  32.2 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 		 292 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  31.89 
 
 		 294 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  31.89 
 
 		 294 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  37.04 
 
 		 244 aa  112  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  29.26 
 
 		 368 aa  112  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  39.49 
 
 		 372 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  34.73 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  35.12 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  35.95 
 
 		 405 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  36.31 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  32.58 
 
 		 227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  32.39 
 
 		 417 aa  108  6e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  36.71 
 
 		 276 aa  108  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  36.36 
 
 		 481 aa  108  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  33.15 
 
 		 279 aa  108  8.000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5514  polysaccharide deacetylase  32.28 
 
 		 252 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.77719  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  31.53 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01375  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 218 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  32.49 
 
 		 305 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  30.59 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1037  polysaccharide deacetylase  31.06 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742911 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  35.06 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 		 302 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  33.33 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 		 520 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  29.21 
 
 		 252 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  36.65 
 
 		 479 aa  105  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1551  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  35.85 
 
 		 465 aa  105  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 		 258 aa  105  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  32.11 
 
 		 220 aa  105  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  34.57 
 
 		 291 aa  105  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  35.22 
 
 		 247 aa  105  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  30.39 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  31.46 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  34.81 
 
 		 364 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2175  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  32.99 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  32.63 
 
 		 213 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  32.63 
 
 		 213 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  32.63 
 
 		 213 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0951  polysaccharide deacetylase  33.53 
 
 		 409 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0651013  normal  0.44667 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  35.44 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  35.37 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 		 752 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  34.71 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  32.11 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  31.25 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1912  polysaccharide deacetylase  34.19 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  27.73 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  32.31 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  34.81 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  34.81 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  34.81 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  34.81 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  31.55 
 
 		 537 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  31.58 
 
 		 244 aa  102  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>