More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4179 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4179  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 266 aa  532  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  56.65 
 
 		 283 aa  288  9e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3983  polysaccharide deacetylase  56.65 
 
 		 284 aa  287  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  56.69 
 
 		 285 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2215  putative transmembrane protein  58.27 
 
 		 288 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  55.06 
 
 		 272 aa  271  8.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  57.31 
 
 		 294 aa  268  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  54.2 
 
 		 267 aa  268  5.9999999999999995e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  53.91 
 
 		 286 aa  261  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  55.38 
 
 		 287 aa  261  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  59.52 
 
 		 280 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  55.38 
 
 		 287 aa  257  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  57.31 
 
 		 300 aa  255  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  56.67 
 
 		 287 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0920  polysaccharide deacetylase family protein  55.38 
 
 		 270 aa  251  7e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  55 
 
 		 294 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  55 
 
 		 294 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  54.62 
 
 		 297 aa  244  8e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  58.58 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  57.27 
 
 		 289 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  47.52 
 
 		 349 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  47.52 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3369  polysaccharide deacetylase  38.82 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  38.4 
 
 		 275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  39.82 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02423  acetylxylan esterase  46.7 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  37.7 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  39.64 
 
 		 256 aa  132  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  31.28 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  39.61 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  39.13 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  39.61 
 
 		 280 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  36.7 
 
 		 258 aa  115  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 		 261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 		 285 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  36.71 
 
 		 235 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  31.41 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  31.98 
 
 		 387 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 		 413 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  36.22 
 
 		 425 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  30.88 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 		 479 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  28.21 
 
 		 251 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 243 aa  102  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 		 324 aa  102  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0628  polysaccharide deacetylase  33.48 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  38.6 
 
 		 752 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  32.31 
 
 		 479 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  36.79 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  30.24 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  31.09 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  38.5 
 
 		 404 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  35.33 
 
 		 259 aa  99.4  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 		 220 aa  99  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  35.42 
 
 		 204 aa  98.6  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  31.79 
 
 		 481 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  29.53 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 		 241 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  29.53 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  29.53 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  27.91 
 
 		 247 aa  97.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  29.53 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  29.53 
 
 		 213 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  36.52 
 
 		 430 aa  96.3  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  36.6 
 
 		 413 aa  96.3  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  31.31 
 
 		 241 aa  96.3  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  30.62 
 
 		 1120 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  37.91 
 
 		 353 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1347  polysaccharide deacetylase  41.29 
 
 		 196 aa  94.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0921833  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0646  polysaccharide deacetylase  33.03 
 
 		 275 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  29.53 
 
 		 244 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  29.53 
 
 		 217 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 392 aa  92.4  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  27.69 
 
 		 244 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  29.1 
 
 		 372 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  29.61 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  30.34 
 
 		 373 aa  90.1  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  33.14 
 
 		 317 aa  89.7  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  29.19 
 
 		 264 aa  89  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1081  polysaccharide deacetylase  26.38 
 
 		 242 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  34.83 
 
 		 289 aa  87.8  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  38.42 
 
 		 321 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1515  polysaccharide deacetylase  33.52 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.416831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0951  polysaccharide deacetylase  39.1 
 
 		 409 aa  87.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0651013  normal  0.44667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1978  polysaccharide deacetylase  29.65 
 
 		 229 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  35.16 
 
 		 244 aa  86.3  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 217 aa  86.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  27.75 
 
 		 300 aa  85.9  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  31.18 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  29.85 
 
 		 927 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  29.85 
 
 		 1115 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  29.85 
 
 		 1119 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.85 
 
 		 1115 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  25.13 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  35.47 
 
 		 468 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>