More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6095 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
297 aa  578  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  88.89 
 
 
294 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  89.23 
 
 
294 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  89.23 
 
 
294 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  86.33 
 
 
300 aa  424  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  77.14 
 
 
287 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  73.87 
 
 
287 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  80.43 
 
 
287 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  63.5 
 
 
272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  62.6 
 
 
283 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  61.98 
 
 
267 aa  299  5e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  59.4 
 
 
285 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  60.16 
 
 
286 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2215  putative transmembrane protein  60.39 
 
 
288 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814206  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  57.82 
 
 
289 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4179  polysaccharide deacetylase  54.23 
 
 
266 aa  258  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  54.09 
 
 
280 aa  249  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  57.95 
 
 
300 aa  249  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3983  polysaccharide deacetylase  51.99 
 
 
284 aa  249  5e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0920  polysaccharide deacetylase family protein  52.81 
 
 
270 aa  226  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  44.96 
 
 
349 aa  188  9e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  44.96 
 
 
246 aa  187  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  39.5 
 
 
275 aa  145  8.000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  41.1 
 
 
275 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  36.62 
 
 
256 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3369  polysaccharide deacetylase  37.8 
 
 
259 aa  135  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792887  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02423  acetylxylan esterase  40.1 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  31.89 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 
299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  33.52 
 
 
261 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  34.84 
 
 
251 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  29.21 
 
 
301 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  36.77 
 
 
258 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  32.95 
 
 
240 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  40.88 
 
 
259 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  37.42 
 
 
285 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  33.52 
 
 
373 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  41.03 
 
 
280 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  30.69 
 
 
258 aa  103  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  41.05 
 
 
280 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  42.04 
 
 
280 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  37.78 
 
 
235 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  26.91 
 
 
481 aa  99.8  6e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 
425 aa  99.4  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  34.66 
 
 
387 aa  99  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  37.58 
 
 
244 aa  97.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  34.94 
 
 
220 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  28.77 
 
 
479 aa  97.4  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  34.34 
 
 
213 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  32.37 
 
 
372 aa  97.1  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  34.34 
 
 
213 aa  97.4  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  34.34 
 
 
213 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  34.34 
 
 
213 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  38.75 
 
 
204 aa  97.1  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  30.86 
 
 
479 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  34.94 
 
 
241 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  34.34 
 
 
241 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  34.84 
 
 
247 aa  96.7  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  28.49 
 
 
244 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  33.33 
 
 
241 aa  94  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  33.14 
 
 
241 aa  93.6  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  33.73 
 
 
217 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  33.95 
 
 
244 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  34.2 
 
 
1120 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  27.96 
 
 
243 aa  93.2  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  32.3 
 
 
276 aa  92.8  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01375  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 
218 aa  91.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  31.11 
 
 
324 aa  91.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  32.56 
 
 
204 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  31.68 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  31.68 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  31.68 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  31.68 
 
 
275 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  31.06 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  31.68 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 
405 aa  90.9  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  31.06 
 
 
275 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  28.85 
 
 
263 aa  90.1  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  31.06 
 
 
275 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 
321 aa  90.1  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  32.48 
 
 
240 aa  89.7  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  31.06 
 
 
275 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 
537 aa  89.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  36.6 
 
 
413 aa  89.7  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  28.41 
 
 
368 aa  89.4  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2978  polysaccharide deacetylase  40 
 
 
205 aa  89  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000961865  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 
255 aa  88.2  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0646  polysaccharide deacetylase  39.63 
 
 
275 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6669  polysaccharide deacetylase  35.6 
 
 
240 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.422259  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  37.74 
 
 
273 aa  88.6  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0538  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 
323 aa  87  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0863369  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  32.37 
 
 
417 aa  87  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  36.54 
 
 
404 aa  87  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  38.21 
 
 
430 aa  87  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 
247 aa  87  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 
352 aa  85.9  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  33.12 
 
 
283 aa  85.5  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_002950  PG2145  polysaccharide deacetylase  35.95 
 
 
201 aa  85.1  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 
542 aa  84.7  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 
221 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>