More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1497 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
275 aa  558  1e-158  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  98.18 
 
 
275 aa  550  1e-155  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3369  polysaccharide deacetylase  57.66 
 
 
259 aa  289  4e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792887  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02423  acetylxylan esterase  66.67 
 
 
260 aa  285  7e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  42.36 
 
 
272 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  43.37 
 
 
300 aa  152  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  43.37 
 
 
294 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  42.93 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  39.26 
 
 
283 aa  146  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4179  polysaccharide deacetylase  39.37 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  43.39 
 
 
300 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  40.55 
 
 
287 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  41.01 
 
 
287 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  42.72 
 
 
289 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  36.67 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  42.35 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  39.91 
 
 
294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  39.91 
 
 
294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  41.84 
 
 
287 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  38.01 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  38.16 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3983  polysaccharide deacetylase  36.08 
 
 
284 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2215  putative transmembrane protein  40.2 
 
 
288 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814206  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0920  polysaccharide deacetylase family protein  36 
 
 
270 aa  122  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  34.81 
 
 
246 aa  119  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  34.2 
 
 
258 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  33.18 
 
 
349 aa  118  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  35.14 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  33.14 
 
 
481 aa  112  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  30.91 
 
 
256 aa  108  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  37.84 
 
 
267 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  37.82 
 
 
280 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  27.73 
 
 
259 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  34.97 
 
 
243 aa  103  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  30 
 
 
251 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  36.48 
 
 
280 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  36.72 
 
 
468 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  28.95 
 
 
221 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  27.78 
 
 
234 aa  98.2  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
301 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  37.85 
 
 
542 aa  98.2  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  31.87 
 
 
240 aa  98.2  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  35 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 
479 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  31.25 
 
 
479 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  30.73 
 
 
372 aa  96.3  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  37.82 
 
 
280 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  29.05 
 
 
247 aa  95.5  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  25.51 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  29.47 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2571  polysaccharide deacetylase  29.5 
 
 
235 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  32.88 
 
 
404 aa  93.2  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
234 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  26.9 
 
 
234 aa  92.4  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  27.78 
 
 
234 aa  92  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  31.79 
 
 
305 aa  92  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  34.43 
 
 
273 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 
252 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  32.72 
 
 
299 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  26.77 
 
 
234 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
217 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
234 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
250 aa  91.3  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  30.16 
 
 
250 aa  90.5  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 
353 aa  90.1  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  35.85 
 
 
244 aa  90.1  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  40 
 
 
259 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1702  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
234 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1880  putative polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
234 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1836  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
234 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 
277 aa  89.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
465 aa  89.4  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  25.81 
 
 
279 aa  89  9e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  29.95 
 
 
244 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 
387 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  35.91 
 
 
227 aa  88.2  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  30.4 
 
 
1120 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  32.12 
 
 
417 aa  87.4  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  26.77 
 
 
234 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  30.23 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  32.61 
 
 
413 aa  87.8  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  30.45 
 
 
237 aa  87  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  27.36 
 
 
258 aa  87  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  30.54 
 
 
405 aa  87  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  24.77 
 
 
294 aa  86.7  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 
275 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 
273 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  30.05 
 
 
291 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  31.29 
 
 
238 aa  85.5  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  27.42 
 
 
321 aa  85.5  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  30.05 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  32.95 
 
 
392 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  32 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  32.69 
 
 
372 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  28.96 
 
 
368 aa  84.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  27.66 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0538  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 
323 aa  84  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0863369  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  34.66 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>