More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0930 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 246 aa  502  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 		 349 aa  499  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4179  polysaccharide deacetylase  47.93 
 
 		 266 aa  211  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3983  polysaccharide deacetylase  47.06 
 
 		 284 aa  206  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  47.03 
 
 		 287 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  47.23 
 
 		 287 aa  201  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  47.23 
 
 		 283 aa  200  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  47.66 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  49.79 
 
 		 300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  44.44 
 
 		 294 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  46.84 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  45.96 
 
 		 294 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  45.96 
 
 		 294 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  44.07 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0920  polysaccharide deacetylase family protein  46.52 
 
 		 270 aa  189  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  47.09 
 
 		 289 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  45.3 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2215  putative transmembrane protein  44.73 
 
 		 288 aa  185  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  43.04 
 
 		 285 aa  184  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  46.15 
 
 		 300 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  46.01 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  47.23 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  37.57 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  36.87 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  34.12 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02423  acetylxylan esterase  36.61 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  34.19 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  35.39 
 
 		 261 aa  122  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3369  polysaccharide deacetylase  34.17 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  34.81 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  31.22 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  39.88 
 
 		 280 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  34.9 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  37.02 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  34.34 
 
 		 479 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  30.93 
 
 		 368 aa  109  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  32.02 
 
 		 258 aa  108  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  32.02 
 
 		 299 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  38.22 
 
 		 204 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 		 321 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  39.74 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  33.78 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  33 
 
 		 481 aa  106  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  35.6 
 
 		 413 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2145  polysaccharide deacetylase  35.33 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  31.22 
 
 		 301 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  31.44 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  34.47 
 
 		 752 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  39.74 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  36.57 
 
 		 244 aa  102  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  29.56 
 
 		 387 aa  101  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  35.5 
 
 		 353 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1515  polysaccharide deacetylase  35.52 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.416831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 479 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  33.51 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  31.95 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  30.34 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  31.22 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0244  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 208 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  29.28 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 		 233 aa  99.8  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 		 213 aa  99.4  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 		 213 aa  99.4  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 		 213 aa  99.4  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  31.71 
 
 		 1120 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  36.07 
 
 		 413 aa  99  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01375  polysaccharide deacetylase  34.08 
 
 		 218 aa  99  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 		 241 aa  99  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 		 213 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  28.86 
 
 		 275 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  32.98 
 
 		 244 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 1101 aa  97.4  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  34.95 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1185  polysaccharide deacetylase  33.98 
 
 		 236 aa  96.3  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  28.71 
 
 		 275 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  27.59 
 
 		 275 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  34.81 
 
 		 211 aa  95.9  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0141  polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 		 216 aa  96.3  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  32.68 
 
 		 1124 aa  95.9  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  28.08 
 
 		 275 aa  95.9  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 		 275 aa  95.9  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2237  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 215 aa  95.9  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  28.22 
 
 		 275 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  28.08 
 
 		 275 aa  95.9  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1551  polysaccharide deacetylase  39.1 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 		 199 aa  95.5  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  27.36 
 
 		 275 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 		 247 aa  95.5  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  30.96 
 
 		 241 aa  95.1  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1978  polysaccharide deacetylase  34.95 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  30.33 
 
 		 372 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 		 221 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  33.55 
 
 		 217 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 		 503 aa  94.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>