More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1541 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 280 aa  521  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  97.69 
 
 		 280 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  94.23 
 
 		 280 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  33.93 
 
 		 240 aa  126  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  41.77 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  45.51 
 
 		 283 aa  119  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  42.47 
 
 		 267 aa  118  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  44.2 
 
 		 272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4179  polysaccharide deacetylase  38.5 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  39.83 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  43.02 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3369  polysaccharide deacetylase  41.46 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  34.36 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  41.67 
 
 		 287 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  38 
 
 		 468 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  40.1 
 
 		 217 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  30.62 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  39.68 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  41.11 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  39.3 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0920  polysaccharide deacetylase family protein  39.53 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  39.5 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  41.05 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02423  acetylxylan esterase  41.67 
 
 		 260 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  32.38 
 
 		 479 aa  108  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  39.74 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 479 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  36.21 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  39.74 
 
 		 349 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  36.32 
 
 		 244 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  35.55 
 
 		 392 aa  105  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  40.34 
 
 		 294 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  40.34 
 
 		 294 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  41.24 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  37.61 
 
 		 413 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  37.86 
 
 		 503 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  37.18 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  34.01 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  31.58 
 
 		 481 aa  102  6e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  37.18 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  32.6 
 
 		 264 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  30.46 
 
 		 372 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  36.77 
 
 		 286 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.28 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3983  polysaccharide deacetylase  35.4 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 317 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1185  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.4 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  38.5 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  36.55 
 
 		 430 aa  99.8  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  28.85 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 		 221 aa  99.4  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  25.98 
 
 		 234 aa  99  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  25.49 
 
 		 234 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  25.49 
 
 		 234 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  34.36 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  31.52 
 
 		 259 aa  98.6  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  25.49 
 
 		 261 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  25.98 
 
 		 234 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  25.98 
 
 		 234 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  31.53 
 
 		 241 aa  97.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1515  polysaccharide deacetylase  35.1 
 
 		 222 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.416831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  25.98 
 
 		 234 aa  96.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2215  putative transmembrane protein  36.98 
 
 		 288 aa  96.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  33.82 
 
 		 320 aa  96.3  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  34.83 
 
 		 404 aa  96.3  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  24.89 
 
 		 234 aa  95.9  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1702  polysaccharide deacetylase  26.47 
 
 		 234 aa  95.5  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  36.22 
 
 		 212 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1836  polysaccharide deacetylase  26.47 
 
 		 234 aa  95.5  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1880  putative polysaccharide deacetylase  26.47 
 
 		 234 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  26.27 
 
 		 258 aa  95.5  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1978  polysaccharide deacetylase  32.55 
 
 		 229 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  30.95 
 
 		 277 aa  95.5  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  26.17 
 
 		 300 aa  95.5  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0475  polysaccharide deacetylase  35.43 
 
 		 336 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0117021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 		 405 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3341  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 		 224 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  27.23 
 
 		 244 aa  93.6  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  29.56 
 
 		 213 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  29.56 
 
 		 213 aa  93.2  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  29.56 
 
 		 213 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  32.47 
 
 		 373 aa  93.6  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  38.71 
 
 		 235 aa  92.8  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  42.5 
 
 		 284 aa  93.2  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  29.56 
 
 		 241 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  38.14 
 
 		 229 aa  92.8  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 		 220 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  31.43 
 
 		 373 aa  92.8  6e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  27.23 
 
 		 248 aa  92.4  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  28.95 
 
 		 256 aa  92.4  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0341  polysaccharide deacetylase  34.12 
 
 		 335 aa  92.4  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>