More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2417 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
280 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  94.62 
 
 
280 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  94.27 
 
 
280 aa  427  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  42.42 
 
 
289 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  33.93 
 
 
240 aa  125  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  46.5 
 
 
283 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  42.47 
 
 
267 aa  122  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4179  polysaccharide deacetylase  39.57 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  40.49 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02423  acetylxylan esterase  42.17 
 
 
260 aa  119  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  41.97 
 
 
217 aa  118  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  42.47 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3369  polysaccharide deacetylase  42.68 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792887  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  40.61 
 
 
294 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  41.67 
 
 
246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  42.93 
 
 
287 aa  116  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  42.63 
 
 
300 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  41.67 
 
 
349 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  33.98 
 
 
364 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  41.54 
 
 
287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  42.68 
 
 
280 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  43.75 
 
 
287 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  38.21 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  40.31 
 
 
468 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  37.04 
 
 
244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  35.32 
 
 
392 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  40 
 
 
294 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  40 
 
 
294 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  32.37 
 
 
481 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  37.82 
 
 
275 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.33 
 
 
250 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  37.67 
 
 
286 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  37.82 
 
 
275 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  40.11 
 
 
413 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  35.9 
 
 
372 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0920  polysaccharide deacetylase family protein  39.07 
 
 
270 aa  105  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  32.7 
 
 
479 aa  105  8e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  37.75 
 
 
503 aa  105  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  30.93 
 
 
256 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  38.42 
 
 
320 aa  105  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  30.62 
 
 
302 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  40.53 
 
 
297 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  32.73 
 
 
479 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  38.1 
 
 
283 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2215  putative transmembrane protein  38.02 
 
 
288 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814206  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  34.76 
 
 
244 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.88 
 
 
251 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 
221 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  29.33 
 
 
279 aa  101  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  27.13 
 
 
261 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
317 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  31.71 
 
 
259 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  31.22 
 
 
247 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0341  polysaccharide deacetylase  35.55 
 
 
335 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3983  polysaccharide deacetylase  38.12 
 
 
284 aa  100  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  31 
 
 
372 aa  99.8  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  30.14 
 
 
243 aa  99.4  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  31.4 
 
 
224 aa  99.4  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  37.63 
 
 
212 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1185  polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 
236 aa  98.2  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 
264 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 
404 aa  97.8  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  27.42 
 
 
258 aa  97.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 
258 aa  97.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  32.45 
 
 
264 aa  97.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  27.88 
 
 
244 aa  97.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1515  polysaccharide deacetylase  35.86 
 
 
222 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.416831  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  24.45 
 
 
234 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  30.93 
 
 
405 aa  96.3  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  24.02 
 
 
234 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1978  polysaccharide deacetylase  32.39 
 
 
229 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 
542 aa  95.9  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  25.49 
 
 
234 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  37.97 
 
 
317 aa  95.5  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  30.99 
 
 
275 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  33 
 
 
387 aa  95.5  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0475  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 
336 aa  95.5  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0117021  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  26.29 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  26.34 
 
 
258 aa  95.1  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  26.57 
 
 
368 aa  95.1  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  25.98 
 
 
234 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  38.62 
 
 
235 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  31.53 
 
 
241 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  31.41 
 
 
321 aa  94.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  30.99 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  37.91 
 
 
430 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  27.68 
 
 
248 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  25.98 
 
 
234 aa  94  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  24.89 
 
 
234 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  25.98 
 
 
234 aa  94  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  30.7 
 
 
277 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  36.06 
 
 
1101 aa  94  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  29.95 
 
 
244 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  30.52 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  30.52 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  32.63 
 
 
440 aa  93.2  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  30.52 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0141  polysaccharide deacetylase  35 
 
 
216 aa  93.2  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>