More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1987 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 256 aa  527  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  35.78 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  40.39 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  33.04 
 
 		 261 aa  149  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  32.38 
 
 		 243 aa  145  8.000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  37.76 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  43.04 
 
 		 297 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  35.35 
 
 		 468 aa  138  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  43.87 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  37.02 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  36.87 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  41.83 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  43.14 
 
 		 287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  37.44 
 
 		 299 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  36.24 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  36.87 
 
 		 349 aa  136  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  36.24 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  33.78 
 
 		 286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  39.22 
 
 		 280 aa  132  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  41.29 
 
 		 287 aa  131  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3983  polysaccharide deacetylase  34.56 
 
 		 284 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 		 387 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  32.11 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  33.83 
 
 		 373 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 		 272 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  31.65 
 
 		 481 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  36.31 
 
 		 417 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  37.23 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  32.76 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4179  polysaccharide deacetylase  39.39 
 
 		 266 aa  126  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  35.89 
 
 		 277 aa  126  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  39.35 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  38.27 
 
 		 300 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 263 aa  125  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  35.03 
 
 		 267 aa  125  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 		 479 aa  125  7e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  31.36 
 
 		 479 aa  125  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 256 aa  125  9e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  37.36 
 
 		 465 aa  124  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  40.91 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.66 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2215  putative transmembrane protein  36.26 
 
 		 288 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  38.46 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  37.76 
 
 		 302 aa  120  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  35.76 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  30.08 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  39.24 
 
 		 244 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  32.28 
 
 		 324 aa  118  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  34.66 
 
 		 503 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  34.27 
 
 		 520 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  34.8 
 
 		 1120 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  32.31 
 
 		 405 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 		 352 aa  115  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  36.07 
 
 		 259 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0920  polysaccharide deacetylase family protein  33.84 
 
 		 270 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 		 235 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  37.66 
 
 		 284 aa  115  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 		 244 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  36 
 
 		 413 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 		 292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 		 372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6669  polysaccharide deacetylase  29.33 
 
 		 240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.422259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  31.98 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  32.12 
 
 		 364 aa  112  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  32.45 
 
 		 221 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 		 275 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  34.66 
 
 		 291 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  34.3 
 
 		 522 aa  111  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  32.23 
 
 		 927 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  32.23 
 
 		 1115 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 		 212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.23 
 
 		 1115 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  31.39 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  34.42 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  32.23 
 
 		 1119 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  34.59 
 
 		 353 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  32.4 
 
 		 404 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  35.06 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.78 
 
 		 1115 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  30.91 
 
 		 275 aa  108  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  32.26 
 
 		 279 aa  108  9.000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  33.84 
 
 		 273 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  39.1 
 
 		 425 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  31.64 
 
 		 522 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  30.48 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  30.48 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  29.5 
 
 		 368 aa  107  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  30.48 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  34.54 
 
 		 240 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  30.48 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  30.85 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  34.41 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 199 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 430 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>