More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1550 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 244 aa  486  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  59.33 
 
 		 252 aa  243  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0628  polysaccharide deacetylase  45.29 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  46.36 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5514  polysaccharide deacetylase  45.12 
 
 		 252 aa  175  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.77719  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0646  polysaccharide deacetylase  47.24 
 
 		 275 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1037  polysaccharide deacetylase  47.25 
 
 		 269 aa  165  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6669  polysaccharide deacetylase  43.87 
 
 		 240 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.422259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1548  polysaccharide deacetylase  42.86 
 
 		 235 aa  131  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.402351  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  43.87 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  37.65 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  42.14 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  34.25 
 
 		 233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  39.22 
 
 		 244 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  40.94 
 
 		 212 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  32.24 
 
 		 405 aa  112  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  35.48 
 
 		 417 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  31.44 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  35.26 
 
 		 373 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  36.16 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  35.06 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 		 387 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  35.06 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  36.6 
 
 		 425 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  38.46 
 
 		 404 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  32.24 
 
 		 372 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  37.93 
 
 		 232 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  35.64 
 
 		 324 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  36.88 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  33.99 
 
 		 221 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  38.46 
 
 		 244 aa  105  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  42.77 
 
 		 267 aa  105  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  35.54 
 
 		 199 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  31.45 
 
 		 368 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  36.13 
 
 		 299 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1185  polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 		 409 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  36.26 
 
 		 927 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  36.26 
 
 		 1115 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  36.26 
 
 		 1119 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  36.26 
 
 		 1115 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  31.76 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  36.26 
 
 		 1115 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  36.26 
 
 		 1115 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  31.95 
 
 		 302 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  35.44 
 
 		 373 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  35.43 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  35.11 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1912  polysaccharide deacetylase  34.84 
 
 		 232 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  34.13 
 
 		 413 aa  99.8  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  32.03 
 
 		 305 aa  99.4  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  36.26 
 
 		 872 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1081  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 		 242 aa  99  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  28.84 
 
 		 240 aa  99  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  34.64 
 
 		 264 aa  98.6  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  36.22 
 
 		 317 aa  98.6  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  37.58 
 
 		 301 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  38.96 
 
 		 215 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  32.53 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 289 aa  97.4  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  36.93 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2215  putative transmembrane protein  35.35 
 
 		 288 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  32.9 
 
 		 220 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1551  polysaccharide deacetylase  37.36 
 
 		 243 aa  95.1  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 		 276 aa  95.1  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  33.33 
 
 		 241 aa  95.1  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  32.9 
 
 		 213 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 284 aa  95.1  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 		 520 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  35.67 
 
 		 430 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  25.26 
 
 		 258 aa  94.4  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  36.31 
 
 		 352 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  32.7 
 
 		 320 aa  94  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  32.9 
 
 		 241 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1579  polysaccharide deacetylase  32.68 
 
 		 251 aa  93.6  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  37.11 
 
 		 300 aa  94  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  32.18 
 
 		 229 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 465 aa  93.2  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  29.1 
 
 		 275 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 		 213 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  29.1 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 		 213 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 		 217 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  29.1 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  37.08 
 
 		 259 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  35.29 
 
 		 468 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  29.1 
 
 		 275 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  29.1 
 
 		 275 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 		 213 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.61 
 
 		 250 aa  93.2  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  34.81 
 
 		 285 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  31.07 
 
 		 258 aa  92.8  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  32.26 
 
 		 244 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  31.32 
 
 		 204 aa  92.4  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0951  polysaccharide deacetylase  36.54 
 
 		 409 aa  92.4  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0651013  normal  0.44667 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  35.71 
 
 		 283 aa  92  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  34.3 
 
 		 392 aa  92  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 275 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>