More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1257 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 235 aa  464  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5514  polysaccharide deacetylase  54.67 
 
 		 252 aa  248  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.77719  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1037  polysaccharide deacetylase  54.91 
 
 		 269 aa  236  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742911 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0628  polysaccharide deacetylase  49.54 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0646  polysaccharide deacetylase  50 
 
 		 275 aa  208  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6669  polysaccharide deacetylase  47.81 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.422259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  46.36 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  46.92 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  38.14 
 
 		 233 aa  155  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  36.71 
 
 		 324 aa  126  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  33.85 
 
 		 373 aa  126  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  34.24 
 
 		 425 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  35 
 
 		 301 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 387 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  34.27 
 
 		 299 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  35.62 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  35.16 
 
 		 417 aa  116  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 		 256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1912  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1548  polysaccharide deacetylase  41.57 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.402351  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  37.84 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  36.87 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  40.11 
 
 		 283 aa  112  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1081  polysaccharide deacetylase  37.97 
 
 		 242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  39.68 
 
 		 404 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  40.98 
 
 		 267 aa  109  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  38.46 
 
 		 241 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  38.06 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  38.06 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  35.38 
 
 		 217 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  39.44 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 		 372 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  32.51 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  37.42 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 		 285 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  37.42 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  37.42 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  37.42 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.33 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  37.42 
 
 		 213 aa  106  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1185  polysaccharide deacetylase  35.22 
 
 		 236 aa  105  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  39.87 
 
 		 250 aa  105  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01375  polysaccharide deacetylase  29.59 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  31.41 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  30.29 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  40.12 
 
 		 280 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1515  polysaccharide deacetylase  36.26 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.416831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 		 286 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  32.39 
 
 		 405 aa  105  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  31.79 
 
 		 264 aa  105  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0920  polysaccharide deacetylase family protein  35.27 
 
 		 270 aa  105  9e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 		 246 aa  104  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  37.91 
 
 		 204 aa  104  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  34.02 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  41.98 
 
 		 352 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1185  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 		 409 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  32.42 
 
 		 373 aa  103  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  37.13 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  37.22 
 
 		 287 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 		 368 aa  102  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  31.15 
 
 		 305 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  40.66 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4179  polysaccharide deacetylase  36.31 
 
 		 266 aa  102  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  36.76 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  38.04 
 
 		 289 aa  101  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  36.13 
 
 		 244 aa  101  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  29.78 
 
 		 291 aa  101  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  36.13 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  35.26 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  36.98 
 
 		 1099 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  37.78 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  36.81 
 
 		 503 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  29.69 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  29.47 
 
 		 279 aa  99.8  3e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  35.26 
 
 		 199 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1551  polysaccharide deacetylase  44.16 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1579  polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 		 251 aa  99.4  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  33.47 
 
 		 1120 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 		 256 aa  99.4  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  34.55 
 
 		 258 aa  99  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 		 242 aa  98.6  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  35.06 
 
 		 291 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0172  putative polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135506  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  33.91 
 
 		 275 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  34.62 
 
 		 468 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  37.01 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  36.07 
 
 		 307 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  28.7 
 
 		 263 aa  97.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0163  putative polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 254 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000107726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1978  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.77 
 
 		 1115 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  31.77 
 
 		 927 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0145  xylanase/chitin deacetylase  33.5 
 
 		 254 aa  97.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  31.77 
 
 		 1115 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  28.18 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  31.15 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>