More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0628 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0628  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 268 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0646  polysaccharide deacetylase  83.19 
 
 		 275 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5514  polysaccharide deacetylase  53.74 
 
 		 252 aa  229  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.77719  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  48.66 
 
 		 235 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1037  polysaccharide deacetylase  53.2 
 
 		 269 aa  212  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742911 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  44.77 
 
 		 244 aa  188  9e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  45.09 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6669  polysaccharide deacetylase  44.44 
 
 		 240 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.422259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  36.7 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  33.02 
 
 		 324 aa  115  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1548  polysaccharide deacetylase  43.45 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.402351  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  39.61 
 
 		 387 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  34.16 
 
 		 405 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  32.98 
 
 		 373 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1912  polysaccharide deacetylase  36.17 
 
 		 232 aa  106  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  30.09 
 
 		 264 aa  105  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 221 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  33.15 
 
 		 417 aa  103  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  32.03 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  33.48 
 
 		 430 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  42.68 
 
 		 317 aa  102  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  35 
 
 		 204 aa  102  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  39.69 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  36.65 
 
 		 285 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 		 227 aa  99  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4179  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 		 266 aa  98.6  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  37.25 
 
 		 250 aa  98.6  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  28 
 
 		 279 aa  98.6  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 		 240 aa  98.2  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 		 352 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  34.44 
 
 		 241 aa  96.7  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  30.73 
 
 		 301 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 372 aa  95.9  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 		 286 aa  95.9  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 287 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  33.99 
 
 		 244 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  26.94 
 
 		 368 aa  94.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1185  polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 		 409 aa  94  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  31.77 
 
 		 242 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  32.57 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  32.53 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 289 aa  92.8  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  33.84 
 
 		 465 aa  92.8  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  36.25 
 
 		 300 aa  92.4  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  36.51 
 
 		 413 aa  92.4  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  28.09 
 
 		 291 aa  92.4  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  32.4 
 
 		 256 aa  92  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  39.35 
 
 		 488 aa  92  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  34.64 
 
 		 373 aa  92  9e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  31.4 
 
 		 413 aa  91.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  30.97 
 
 		 251 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  32.22 
 
 		 302 aa  92  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  33.33 
 
 		 349 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  30.11 
 
 		 425 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3360  polysaccharide deacetylase  38.99 
 
 		 202 aa  90.9  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0110446 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  33.33 
 
 		 283 aa  90.9  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1579  polysaccharide deacetylase  33.87 
 
 		 251 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  34.59 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  32.28 
 
 		 404 aa  90.9  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  31.06 
 
 		 204 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3983  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 284 aa  90.1  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1515  polysaccharide deacetylase  31.18 
 
 		 222 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.416831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  33.2 
 
 		 272 aa  89.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  36.94 
 
 		 267 aa  89.7  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 286 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1834  polysaccharide deacetylase  34.63 
 
 		 397 aa  89.4  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  28.93 
 
 		 1001 aa  88.6  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  28.37 
 
 		 481 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  34.31 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6465  polysaccharide deacetylase  33.96 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  31.38 
 
 		 479 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  29.87 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 522 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  34.57 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 		 217 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0920  polysaccharide deacetylase family protein  31.06 
 
 		 270 aa  86.7  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 		 261 aa  86.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  35.33 
 
 		 392 aa  87  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  33.89 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  33.73 
 
 		 479 aa  86.3  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  26.4 
 
 		 259 aa  86.3  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  30.86 
 
 		 267 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2215  putative transmembrane protein  34.95 
 
 		 288 aa  86.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 465 aa  85.9  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 		 289 aa  85.9  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 		 262 aa  85.5  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  24.86 
 
 		 258 aa  85.5  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0408  peptidoglycan GlcNAc deacetylase  30.56 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  36.87 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  27.17 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01375  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  30.43 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  37.34 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0811  polysaccharide deacetylase  28.99 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.636434  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  27.92 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>