More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0646 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0646  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 275 aa  530  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0628  polysaccharide deacetylase  83.19 
 
 		 268 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5514  polysaccharide deacetylase  53.31 
 
 		 252 aa  238  9e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.77719  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  48.68 
 
 		 235 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1037  polysaccharide deacetylase  50.45 
 
 		 269 aa  209  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742911 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  46.7 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6669  polysaccharide deacetylase  44.59 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.422259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  46.46 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  35.94 
 
 		 233 aa  142  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1912  polysaccharide deacetylase  37.38 
 
 		 232 aa  109  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1548  polysaccharide deacetylase  42.86 
 
 		 235 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.402351  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  32.92 
 
 		 405 aa  108  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  38.96 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  33 
 
 		 324 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  28.82 
 
 		 264 aa  105  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  29.83 
 
 		 292 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  32.28 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  33.54 
 
 		 417 aa  100  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  34.93 
 
 		 285 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  32.37 
 
 		 287 aa  99  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  29.26 
 
 		 373 aa  99  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  28.12 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  33.62 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  32.03 
 
 		 221 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  37.25 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  30.11 
 
 		 425 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1185  polysaccharide deacetylase  36.67 
 
 		 409 aa  97.8  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 430 aa  97.1  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  35.95 
 
 		 373 aa  97.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  35.06 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 		 204 aa  95.5  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  37.11 
 
 		 284 aa  95.1  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  38.85 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  25.52 
 
 		 368 aa  95.1  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  33.99 
 
 		 244 aa  94  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  32.28 
 
 		 204 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 241 aa  93.2  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.61 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  35.37 
 
 		 294 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  35.37 
 
 		 294 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  29.22 
 
 		 240 aa  92  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  36.16 
 
 		 352 aa  92  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  30.57 
 
 		 301 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  34.73 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  32.4 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  34.48 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2215  putative transmembrane protein  34.91 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1579  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 		 251 aa  90.5  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  30.68 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  34.57 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4179  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  37.57 
 
 		 522 aa  89.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  29.09 
 
 		 259 aa  89  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 286 aa  89  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  36.36 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  30.14 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  39.63 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 		 465 aa  88.6  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  31.55 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  28.32 
 
 		 372 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1081  polysaccharide deacetylase  29 
 
 		 242 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  29.41 
 
 		 481 aa  87  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  35.64 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  35.43 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1515  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 		 222 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.416831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  25.71 
 
 		 276 aa  86.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1185  polysaccharide deacetylase  29.49 
 
 		 236 aa  86.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 217 aa  86.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  25.24 
 
 		 275 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  36.6 
 
 		 289 aa  85.5  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  25.71 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  25.71 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  25.71 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  30.81 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  37.25 
 
 		 468 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0408  peptidoglycan GlcNAc deacetylase  28.24 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  32.29 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 		 247 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  25.71 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3360  polysaccharide deacetylase  37.18 
 
 		 202 aa  85.1  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0110446 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  30.86 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  36.97 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  25.24 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  35.98 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  27.22 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  32.1 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1728  polysaccharide deacetylase family protein  30.49 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000179283  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  27.04 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  25.24 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  25.24 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  26.18 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>