More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1579 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 262 aa  533  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  54.63 
 
 		 242 aa  246  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  42.61 
 
 		 352 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  41.08 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  41.62 
 
 		 542 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  41.94 
 
 		 417 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  32.9 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  39 
 
 		 320 aa  133  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  40.74 
 
 		 307 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  38.07 
 
 		 221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  36.96 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  33.91 
 
 		 405 aa  121  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  35.87 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  36.41 
 
 		 373 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  38.55 
 
 		 503 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  38.59 
 
 		 353 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  35.27 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  33.04 
 
 		 465 aa  119  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  37.91 
 
 		 373 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 387 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  38.89 
 
 		 287 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  34.23 
 
 		 273 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  35.18 
 
 		 522 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  35.78 
 
 		 317 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  37.1 
 
 		 468 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  36.7 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  39.47 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  33.69 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  32.24 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 		 273 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  36.46 
 
 		 368 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  34.21 
 
 		 275 aa  112  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 		 273 aa  112  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  34.74 
 
 		 275 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 301 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  31.56 
 
 		 244 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  29.76 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  34.74 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  29.69 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  34.74 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  34.74 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  34.43 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  33.89 
 
 		 488 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  34.74 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  32.31 
 
 		 522 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  29.39 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  37.95 
 
 		 289 aa  109  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  35.5 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  34.74 
 
 		 275 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3149  polysaccharide deacetylase  31.41 
 
 		 345 aa  108  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.442211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 		 273 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 372 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  36.56 
 
 		 199 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3747  polysaccharide deacetylase  29.26 
 
 		 245 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000014318  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 		 321 aa  106  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 		 275 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  32.47 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  32.47 
 
 		 275 aa  105  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  36.06 
 
 		 259 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  33 
 
 		 263 aa  105  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  32.12 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 		 537 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  32.11 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 		 229 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  30.61 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  31 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  34.59 
 
 		 392 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2294  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923024  unclonable  2.97243e-26 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 		 204 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  31.98 
 
 		 871 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  27.08 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  36.46 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 		 240 aa  102  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  34.9 
 
 		 247 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 		 233 aa  102  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2736  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000182255  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  35.05 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  37.82 
 
 		 1099 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  31.22 
 
 		 244 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4727  polysaccharide deacetylase  31.22 
 
 		 357 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000111297  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  28.19 
 
 		 440 aa  100  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  34.76 
 
 		 413 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>