More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2675 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 280 aa  551  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  66.16 
 
 		 300 aa  315  7e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  60.58 
 
 		 267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  57.89 
 
 		 272 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  57.87 
 
 		 286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4179  polysaccharide deacetylase  59.06 
 
 		 266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  55.22 
 
 		 285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  57.03 
 
 		 283 aa  267  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2215  putative transmembrane protein  55.72 
 
 		 288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  56.9 
 
 		 287 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  57.94 
 
 		 287 aa  261  6e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  58.58 
 
 		 294 aa  261  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  62.33 
 
 		 287 aa  258  6e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  58.72 
 
 		 294 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  58.72 
 
 		 294 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0920  polysaccharide deacetylase family protein  57.98 
 
 		 270 aa  257  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3983  polysaccharide deacetylase  54.51 
 
 		 284 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  58.8 
 
 		 297 aa  255  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  60.39 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  53.88 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  45.93 
 
 		 349 aa  208  8e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  47.23 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  41.84 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  36.67 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3369  polysaccharide deacetylase  41.56 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02423  acetylxylan esterase  44.69 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  32.58 
 
 		 259 aa  135  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  39.35 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  32.87 
 
 		 240 aa  119  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 		 305 aa  116  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  33 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  32.65 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  41.14 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  43.04 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  38.33 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  29.49 
 
 		 479 aa  106  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  29.65 
 
 		 251 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  39.49 
 
 		 252 aa  106  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 		 302 aa  106  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5514  polysaccharide deacetylase  37.76 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.77719  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  28.87 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  34.85 
 
 		 468 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  29.68 
 
 		 479 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  38.8 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  42.22 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6669  polysaccharide deacetylase  37.78 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.422259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  32.31 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1912  polysaccharide deacetylase  39.24 
 
 		 232 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 		 372 aa  99.8  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 		 413 aa  99.8  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  29.38 
 
 		 321 aa  99.8  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  30.46 
 
 		 481 aa  99.4  6e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 		 204 aa  99  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  29.67 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  31.9 
 
 		 233 aa  96.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1037  polysaccharide deacetylase  36.76 
 
 		 269 aa  96.3  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742911 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 		 247 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 247 aa  96.3  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  36.09 
 
 		 372 aa  96.3  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 221 aa  95.9  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  37.27 
 
 		 250 aa  96.3  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  30.28 
 
 		 243 aa  96.3  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  29.15 
 
 		 244 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  33.71 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  37.25 
 
 		 413 aa  95.1  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1081  polysaccharide deacetylase  31.51 
 
 		 242 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  30.87 
 
 		 1120 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  37.97 
 
 		 404 aa  94.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  30.89 
 
 		 240 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0628  polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 		 268 aa  93.6  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 		 387 aa  94  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  28.22 
 
 		 417 aa  93.6  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  26.77 
 
 		 368 aa  92.8  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  37.58 
 
 		 430 aa  92.4  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2978  polysaccharide deacetylase  38.13 
 
 		 205 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000961865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 		 542 aa  90.9  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  32.92 
 
 		 229 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  33.94 
 
 		 752 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 		 247 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6465  polysaccharide deacetylase  30.93 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  26.47 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  29.72 
 
 		 353 aa  90.5  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  32.63 
 
 		 244 aa  89.4  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  31.12 
 
 		 291 aa  89  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 227 aa  88.6  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0646  polysaccharide deacetylase  35.32 
 
 		 275 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  31.16 
 
 		 425 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  28.95 
 
 		 373 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  29.56 
 
 		 204 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  33.13 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0908  xylanase/chitin deacetylase  25.81 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01375  polysaccharide deacetylase  29.05 
 
 		 218 aa  87.8  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 		 220 aa  87  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  33.95 
 
 		 241 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  32.58 
 
 		 241 aa  86.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1347  polysaccharide deacetylase  37.63 
 
 		 196 aa  86.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0921833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  31.64 
 
 		 283 aa  86.3  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>