More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3928 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 289 aa  580  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  60.38 
 
 		 287 aa  286  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  60.98 
 
 		 287 aa  285  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  58.63 
 
 		 294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  56.44 
 
 		 267 aa  273  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  53.17 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  61.36 
 
 		 294 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  61.36 
 
 		 294 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  60 
 
 		 287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  55.68 
 
 		 272 aa  265  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  57.66 
 
 		 297 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  59.41 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  53.11 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4179  polysaccharide deacetylase  52.71 
 
 		 266 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  49.3 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  54.44 
 
 		 300 aa  228  8e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3983  polysaccharide deacetylase  50.38 
 
 		 284 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2215  putative transmembrane protein  50.92 
 
 		 288 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  47.7 
 
 		 280 aa  215  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0920  polysaccharide deacetylase family protein  47.69 
 
 		 270 aa  189  7e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  46.06 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  46.06 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  43.69 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3369  polysaccharide deacetylase  42.2 
 
 		 259 aa  143  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  42.72 
 
 		 275 aa  142  9e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02423  acetylxylan esterase  42.16 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  36.98 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  32.42 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  44.5 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  33.94 
 
 		 258 aa  125  9e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  42.02 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  34.32 
 
 		 259 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  34.21 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  43.71 
 
 		 259 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  42.13 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  39.27 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  29.86 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  38.04 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  37.97 
 
 		 413 aa  112  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2145  polysaccharide deacetylase  34.09 
 
 		 201 aa  111  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  30.53 
 
 		 244 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6669  polysaccharide deacetylase  36.91 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.422259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  37.07 
 
 		 204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  29.8 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 		 258 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  42.21 
 
 		 542 aa  106  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 324 aa  105  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 425 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  33.01 
 
 		 479 aa  105  8e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  38.3 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  31.88 
 
 		 220 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 		 235 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  30.85 
 
 		 305 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  30.92 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  30.92 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  30.92 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  30.92 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  31.88 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 		 372 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  28.72 
 
 		 321 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  28.23 
 
 		 368 aa  102  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  31.88 
 
 		 241 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  30.92 
 
 		 241 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  30.09 
 
 		 275 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  31.22 
 
 		 405 aa  102  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  33.55 
 
 		 240 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  32.17 
 
 		 240 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  29.63 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  31.88 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  30.85 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  31.16 
 
 		 479 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  39.13 
 
 		 244 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 199 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 275 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 275 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 275 aa  99.8  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 275 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 275 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  32.5 
 
 		 481 aa  99.4  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 		 302 aa  99  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  37.79 
 
 		 242 aa  99  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  31.58 
 
 		 417 aa  98.6  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  32.51 
 
 		 1120 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  28.33 
 
 		 264 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  31.68 
 
 		 372 aa  97.8  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 		 217 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  28.7 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  36.36 
 
 		 373 aa  97.8  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 		 221 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1037  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 269 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  42.38 
 
 		 752 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01375  polysaccharide deacetylase  29.19 
 
 		 218 aa  97.1  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1081  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 242 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  38.61 
 
 		 217 aa  96.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 		 250 aa  96.7  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>