More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2787 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
404 aa  787    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  51.73 
 
 
413 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0951  polysaccharide deacetylase  54.97 
 
 
409 aa  373  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0651013  normal  0.44667 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  51.24 
 
 
430 aa  362  6e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 
264 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  36.14 
 
 
251 aa  150  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  40.86 
 
 
320 aa  145  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 
220 aa  142  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  35.32 
 
 
241 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  36.79 
 
 
241 aa  140  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 
213 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 
213 aa  139  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 
213 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  37.7 
 
 
294 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  35.75 
 
 
213 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 
324 aa  138  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  39.11 
 
 
417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  33.33 
 
 
244 aa  137  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  35.32 
 
 
241 aa  137  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  35.64 
 
 
247 aa  136  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  35.2 
 
 
250 aa  135  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  35.75 
 
 
244 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  34.83 
 
 
241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  34.01 
 
 
221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  35.75 
 
 
217 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  35 
 
 
387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  34.24 
 
 
302 aa  131  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  34.59 
 
 
263 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  42.93 
 
 
267 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  35.14 
 
 
305 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0147  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  35.83 
 
 
251 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  35.9 
 
 
345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  35.68 
 
 
256 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  38.66 
 
 
413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  39.64 
 
 
317 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0143  xylanase/chitin deacetylase  34.04 
 
 
254 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  42.58 
 
 
284 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  36.67 
 
 
373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0145  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  34.72 
 
 
254 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.268152  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0172  putative polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 
254 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135506  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5154  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  35.23 
 
 
254 aa  127  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000487832  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1515  polysaccharide deacetylase  36.5 
 
 
222 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.416831  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 
238 aa  126  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
228 aa  126  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0163  putative polysaccharide deacetylase  34.04 
 
 
254 aa  126  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000107726 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0145  xylanase/chitin deacetylase  34.04 
 
 
254 aa  126  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  41.9 
 
 
227 aa  125  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  35.11 
 
 
258 aa  125  9e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0150  polysaccharide deacetylase, putative  33.68 
 
 
254 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.647216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0150  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 
254 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00655873  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  36.22 
 
 
261 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0182  putative polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 
254 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0150  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 
254 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  33.33 
 
 
271 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  40.68 
 
 
199 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  31.41 
 
 
327 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1074  polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 
320 aa  123  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0121745  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  36.87 
 
 
258 aa  122  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2458  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  30.16 
 
 
299 aa  122  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0476664  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  33.87 
 
 
279 aa  122  9.999999999999999e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  35.83 
 
 
283 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  35.14 
 
 
204 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0571  polysaccharide deacetylase  35.75 
 
 
309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0152  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  34.22 
 
 
253 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120528  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3904  putative polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 
299 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  32.79 
 
 
292 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  35.75 
 
 
244 aa  121  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  31.38 
 
 
295 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  39.33 
 
 
542 aa  121  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3817  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  35.52 
 
 
344 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0327337  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1443  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
320 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  32.83 
 
 
263 aa  120  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 
255 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3657  polysaccharide deacetylase  31.38 
 
 
299 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3547  polysaccharide deacetylase  31.38 
 
 
299 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3628  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  31.91 
 
 
299 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3565  polysaccharide deacetylase  31.38 
 
 
299 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3817  putative polysaccharide deacetylase  31.38 
 
 
299 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.2968800000000001e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3943  polysaccharide deacetylase  31.38 
 
 
299 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  38.64 
 
 
259 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  36.25 
 
 
232 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0144  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  33.51 
 
 
258 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00172673  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  37.06 
 
 
204 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  32.34 
 
 
260 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  39.27 
 
 
289 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1340  putative polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 
299 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.236296 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  30.37 
 
 
321 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  37.58 
 
 
217 aa  116  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  31.22 
 
 
267 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  34.13 
 
 
219 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3853  putative polysaccharide deacetylase  31.38 
 
 
299 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 
229 aa  116  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3844  polysaccharide deacetylase, putative  31.38 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1963  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 
263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  37.69 
 
 
1119 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  35.98 
 
 
246 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  32.12 
 
 
372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>