More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1963 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1963  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
263 aa  552  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  53.26 
 
 
345 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  52.14 
 
 
294 aa  264  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3817  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  51.01 
 
 
344 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0327337  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1074  polysaccharide deacetylase  52.16 
 
 
320 aa  241  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0121745  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0571  polysaccharide deacetylase  51.5 
 
 
309 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  46.12 
 
 
260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  46.72 
 
 
267 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  44.74 
 
 
271 aa  208  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  44.44 
 
 
260 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  43.16 
 
 
260 aa  202  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0540  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  43.16 
 
 
260 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0217877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  43.16 
 
 
260 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0411  polysaccharide deacetylase  43.16 
 
 
260 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  43.16 
 
 
260 aa  202  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  43.16 
 
 
260 aa  202  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  43.16 
 
 
260 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  43.16 
 
 
260 aa  202  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  43.16 
 
 
260 aa  202  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1836  polysaccharide deacetylase (nodulation protein NodB)  41.05 
 
 
265 aa  191  8e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0269701  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2122  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  40.17 
 
 
265 aa  189  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  45.1 
 
 
286 aa  179  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  35.47 
 
 
405 aa  132  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  36.08 
 
 
259 aa  125  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  34.27 
 
 
276 aa  125  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  33.99 
 
 
251 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  32.41 
 
 
221 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  32.3 
 
 
275 aa  122  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  34.33 
 
 
275 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  34.33 
 
 
275 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  34.33 
 
 
275 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  34.33 
 
 
275 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 
256 aa  122  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  34.33 
 
 
275 aa  122  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0065  polysaccharide deacetylase  35.79 
 
 
365 aa  122  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00184975  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  33.83 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4011  polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 
360 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243359  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  30.57 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  34.04 
 
 
199 aa  119  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  32.84 
 
 
275 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  32.34 
 
 
275 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 
537 aa  115  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  26.94 
 
 
238 aa  115  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 
387 aa  115  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 
404 aa  115  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  31.44 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2458  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  28.35 
 
 
299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0476664  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
503 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1655  polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 
244 aa  113  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  26.94 
 
 
327 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  38.22 
 
 
215 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  37.58 
 
 
212 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  30.92 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0150  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00655873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0150  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  32.82 
 
 
413 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 
320 aa  109  5e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0143  xylanase/chitin deacetylase  31.31 
 
 
254 aa  109  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1443  polysaccharide deacetylase  29.74 
 
 
320 aa  108  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  32.79 
 
 
258 aa  108  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  30.24 
 
 
241 aa  108  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  28.34 
 
 
321 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0145  xylanase/chitin deacetylase  31.31 
 
 
254 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0182  putative polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 
254 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0163  putative polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 
254 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000107726 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0150  polysaccharide deacetylase, putative  31.31 
 
 
254 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.647216  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  29.25 
 
 
251 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
240 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0908  xylanase/chitin deacetylase  27.4 
 
 
235 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  33.7 
 
 
417 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  35.88 
 
 
217 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0172  putative polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 
254 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135506  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  28 
 
 
244 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  28.95 
 
 
373 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 
264 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5154  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.31 
 
 
254 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000487832  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 
465 aa  106  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0145  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  30.81 
 
 
254 aa  105  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.268152  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  30.96 
 
 
258 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3628  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  26.8 
 
 
299 aa  105  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  30.96 
 
 
261 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3844  polysaccharide deacetylase, putative  26.8 
 
 
299 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  31.22 
 
 
292 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 
267 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3853  putative polysaccharide deacetylase  26.8 
 
 
299 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 
228 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1978  polysaccharide deacetylase  31.68 
 
 
229 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3904  putative polysaccharide deacetylase  27.32 
 
 
299 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  31.71 
 
 
321 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1340  putative polysaccharide deacetylase  27.32 
 
 
299 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.236296 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1948  polysaccharide deacetylase  30.5 
 
 
249 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000715916  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
258 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3817  putative polysaccharide deacetylase  26.29 
 
 
299 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.2968800000000001e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0144  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  30.61 
 
 
258 aa  102  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00172673  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3657  polysaccharide deacetylase  26.29 
 
 
299 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3565  polysaccharide deacetylase  26.29 
 
 
299 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3943  polysaccharide deacetylase  26.29 
 
 
299 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  31.75 
 
 
522 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  27.46 
 
 
255 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>