More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3304 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  100 
 
 
241 aa  501  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  92.53 
 
 
241 aa  471  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  91.29 
 
 
241 aa  467  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  90.87 
 
 
244 aa  463  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  94.55 
 
 
220 aa  437  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  93.43 
 
 
213 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  93.43 
 
 
213 aa  422  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  93.43 
 
 
213 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  93.43 
 
 
213 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  92.63 
 
 
217 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  81.33 
 
 
241 aa  420  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  46.86 
 
 
251 aa  231  6e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  45.5 
 
 
244 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  43.72 
 
 
244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  39.9 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  38.81 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  47.47 
 
 
277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  43.88 
 
 
283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  42.5 
 
 
305 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  40.8 
 
 
221 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  39.59 
 
 
302 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  42.66 
 
 
1101 aa  155  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  41.67 
 
 
320 aa  154  9e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  37.44 
 
 
413 aa  153  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  40.86 
 
 
229 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  39.06 
 
 
204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  38.95 
 
 
219 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  42.25 
 
 
317 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  42.86 
 
 
259 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  38.38 
 
 
927 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  38.38 
 
 
1115 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  38.38 
 
 
1119 aa  143  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5576  polysaccharide deacetylase  36.74 
 
 
238 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  38.38 
 
 
1115 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  35.91 
 
 
255 aa  143  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 
522 aa  142  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 
264 aa  140  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.02 
 
 
1115 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  40.76 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  38.5 
 
 
1115 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  39.29 
 
 
1099 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  35.87 
 
 
752 aa  138  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  39.8 
 
 
321 aa  138  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  36.19 
 
 
232 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  35.79 
 
 
405 aa  138  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 
1118 aa  138  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  37.37 
 
 
872 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  35.32 
 
 
404 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  35.98 
 
 
1154 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  34.65 
 
 
217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  41.09 
 
 
354 aa  136  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  36.65 
 
 
372 aa  134  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  37.77 
 
 
291 aa  134  9e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  34.47 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  38.73 
 
 
573 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0147  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  37.75 
 
 
251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 
317 aa  132  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  36.73 
 
 
299 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  33.62 
 
 
276 aa  132  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  38.38 
 
 
199 aa  132  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 
212 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  33.74 
 
 
248 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  33.88 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  34.65 
 
 
465 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  34.42 
 
 
1124 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1625  polysaccharide deacetylase  37.37 
 
 
212 aa  131  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  38.3 
 
 
292 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1978  polysaccharide deacetylase  34.48 
 
 
229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3798  polysaccharide deacetylase  36.28 
 
 
255 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3850  polysaccharide deacetylase  36.28 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  33.62 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  36.22 
 
 
204 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  36.98 
 
 
267 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  32.48 
 
 
275 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0152  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  38.3 
 
 
253 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  33.19 
 
 
275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  33.19 
 
 
275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  36.18 
 
 
240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  33.19 
 
 
275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  35.9 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  36.81 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  35.38 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  36.5 
 
 
250 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  35.38 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  36.9 
 
 
324 aa  126  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  37.77 
 
 
387 aa  126  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01940  predicted xylanase/chitin deacetylase  36.63 
 
 
571 aa  126  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000016994  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2674  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  35.19 
 
 
250 aa  126  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198792  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  39.79 
 
 
247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  35.68 
 
 
258 aa  125  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  35.07 
 
 
1120 aa  125  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  32.75 
 
 
275 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  35.68 
 
 
279 aa  123  3e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 
430 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  35.18 
 
 
373 aa  122  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1185  polysaccharide deacetylase  32.34 
 
 
236 aa  122  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
368 aa  122  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1515  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
222 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.416831  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  34.78 
 
 
364 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>