More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1147 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
267 aa  527  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  47.55 
 
 
522 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  49.61 
 
 
273 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  50.99 
 
 
307 aa  198  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  50.99 
 
 
503 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  52.31 
 
 
287 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  48.44 
 
 
468 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  41.98 
 
 
488 aa  188  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  40.49 
 
 
465 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  42.19 
 
 
417 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 
292 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  33.04 
 
 
291 aa  165  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  45.37 
 
 
537 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  43.46 
 
 
251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  41.97 
 
 
291 aa  159  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  44.04 
 
 
247 aa  159  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  41.33 
 
 
373 aa  159  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  44.04 
 
 
320 aa  155  5.0000000000000005e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  38.72 
 
 
520 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  38.5 
 
 
387 aa  152  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  38.92 
 
 
279 aa  152  5e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2063  polysaccharide deacetylase  47.64 
 
 
248 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3149  polysaccharide deacetylase  41.67 
 
 
345 aa  151  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.442211  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  37.76 
 
 
344 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  42.25 
 
 
258 aa  145  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  38.81 
 
 
247 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  38.01 
 
 
305 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  40.11 
 
 
324 aa  143  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  36.13 
 
 
247 aa  143  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  36.55 
 
 
368 aa  142  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  41.88 
 
 
413 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  38.35 
 
 
373 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  39.41 
 
 
277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  35.32 
 
 
302 aa  139  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  44.89 
 
 
542 aa  139  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  37.17 
 
 
372 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  35.6 
 
 
221 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  37.76 
 
 
244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  38.14 
 
 
299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
522 aa  135  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  38.54 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  38.54 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  38.74 
 
 
241 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  38.54 
 
 
220 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  38.54 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  38.02 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  38.78 
 
 
204 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  39.69 
 
 
241 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  42.05 
 
 
352 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
261 aa  132  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  48.86 
 
 
227 aa  132  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 
217 aa  131  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  37.5 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  37.76 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  40.47 
 
 
752 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  35.57 
 
 
405 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  40.74 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  42.93 
 
 
404 aa  130  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 
275 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  37.07 
 
 
321 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  37.77 
 
 
683 aa  129  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  34.9 
 
 
275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  39.46 
 
 
264 aa  129  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  36.98 
 
 
241 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 
275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 
275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 
275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 
275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0834  polysaccharide deacetylase  37.77 
 
 
239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0811  polysaccharide deacetylase  37.77 
 
 
239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.636434  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  38.1 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  38.66 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  32.8 
 
 
440 aa  126  3e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 
276 aa  126  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  40.43 
 
 
242 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  36.98 
 
 
241 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 
275 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  35.03 
 
 
256 aa  125  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 
256 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  39.3 
 
 
1124 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2458  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  31.41 
 
 
299 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0476664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  37.56 
 
 
1115 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  37.56 
 
 
927 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  35.52 
 
 
255 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  37.56 
 
 
1115 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  37.75 
 
 
1115 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  37.56 
 
 
1119 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 
234 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  38.05 
 
 
872 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 
234 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  32.99 
 
 
234 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  37.02 
 
 
382 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  32.99 
 
 
234 aa  123  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  34.36 
 
 
234 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  41.44 
 
 
413 aa  123  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  39.8 
 
 
1101 aa  123  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 
258 aa  122  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>