More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0113 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
503 aa  967    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  52.22 
 
 
307 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  35.12 
 
 
468 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  34.17 
 
 
488 aa  204  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  49.1 
 
 
267 aa  199  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  34.33 
 
 
537 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  45.5 
 
 
522 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  47.3 
 
 
273 aa  194  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  46.15 
 
 
287 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  45.11 
 
 
387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  41.54 
 
 
465 aa  167  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  42.08 
 
 
417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  36.68 
 
 
292 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  42.7 
 
 
373 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  46.2 
 
 
258 aa  164  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2063  polysaccharide deacetylase  48.53 
 
 
248 aa  161  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  44.28 
 
 
320 aa  159  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 
520 aa  159  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  42.39 
 
 
373 aa  158  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 
291 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  39.11 
 
 
247 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  40.98 
 
 
291 aa  150  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  39.15 
 
 
321 aa  150  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  46.56 
 
 
247 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  39.89 
 
 
324 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  44.32 
 
 
542 aa  144  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  37.76 
 
 
344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  41.76 
 
 
229 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  46.91 
 
 
465 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  44.77 
 
 
692 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  35.79 
 
 
251 aa  137  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  33.03 
 
 
221 aa  137  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  39.78 
 
 
275 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  39.78 
 
 
275 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  39.78 
 
 
275 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  35.14 
 
 
279 aa  136  8e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  39.78 
 
 
275 aa  136  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  39.25 
 
 
276 aa  136  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  40.43 
 
 
352 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  40.44 
 
 
242 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3149  polysaccharide deacetylase  35.11 
 
 
345 aa  135  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.442211  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 
368 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  37.63 
 
 
275 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  39.25 
 
 
317 aa  134  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  37.63 
 
 
275 aa  133  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  35.96 
 
 
440 aa  133  6e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  43.45 
 
 
1001 aa  133  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  39.25 
 
 
275 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  39 
 
 
199 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  38.17 
 
 
275 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  38.17 
 
 
275 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  38.34 
 
 
240 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  32.42 
 
 
405 aa  131  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 
522 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  34.74 
 
 
305 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  45.09 
 
 
227 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  34.38 
 
 
271 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 
251 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01800  chitin deacetylase, putative  33.49 
 
 
470 aa  128  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.61842  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01852  Chitin deacetylasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.41); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BC78]  40.68 
 
 
249 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  32.84 
 
 
275 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  35.6 
 
 
204 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  34.74 
 
 
372 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  32.84 
 
 
275 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  32.84 
 
 
275 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  32.84 
 
 
275 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  32.84 
 
 
275 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  32.84 
 
 
275 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  35.05 
 
 
299 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 
272 aa  123  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  35.2 
 
 
301 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  36.61 
 
 
264 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  32.35 
 
 
275 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2294  polysaccharide deacetylase  34.67 
 
 
260 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923024  unclonable  2.97243e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  32.59 
 
 
275 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  34.08 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  38.55 
 
 
262 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  41.53 
 
 
353 aa  123  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 
244 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  31.9 
 
 
273 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  30.04 
 
 
275 aa  121  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  38.07 
 
 
283 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  33.87 
 
 
273 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2736  polysaccharide deacetylase  34.17 
 
 
275 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000182255  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1228  polysaccharide deacetylase  30.2 
 
 
327 aa  120  6e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  39.7 
 
 
1101 aa  120  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  35.88 
 
 
295 aa  120  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  33.87 
 
 
273 aa  120  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  33.87 
 
 
273 aa  120  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  33.87 
 
 
273 aa  120  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  33.87 
 
 
273 aa  120  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  33.87 
 
 
273 aa  120  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  33.33 
 
 
273 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  33.87 
 
 
273 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  33.87 
 
 
273 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  35.11 
 
 
277 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  28.87 
 
 
261 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  34.67 
 
 
927 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  31.41 
 
 
260 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.5 
 
 
1115 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>