More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF01800 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006691  CNF01800  chitin deacetylase, putative  100 
 
 
470 aa  943    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.61842  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03580  chitin deacetylase, putative  35.74 
 
 
410 aa  156  9e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322784  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03490  chitin deacetylase-like mannoprotein MP98  35.56 
 
 
458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43807  Chitin deacetylase 2 precursor  31.92 
 
 
269 aa  127  5e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0156185  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  33.49 
 
 
503 aa  127  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  36.74 
 
 
373 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 
292 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  32.87 
 
 
251 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  30.93 
 
 
542 aa  109  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
537 aa  106  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 
352 aa  106  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  32.32 
 
 
440 aa  105  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 
199 aa  104  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  32.58 
 
 
258 aa  104  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  30.88 
 
 
267 aa  104  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 
227 aa  103  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  33 
 
 
291 aa  103  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 
465 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  37.34 
 
 
299 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  32.84 
 
 
468 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  31.22 
 
 
320 aa  102  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  32.63 
 
 
287 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  29.77 
 
 
237 aa  99  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 
301 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  33.92 
 
 
240 aa  99  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
247 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  32.82 
 
 
417 aa  98.2  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 
307 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  29.83 
 
 
488 aa  96.7  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0408  peptidoglycan GlcNAc deacetylase  35.97 
 
 
240 aa  96.3  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 
387 aa  96.3  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  28.23 
 
 
520 aa  96.3  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  38.84 
 
 
252 aa  96.3  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 
204 aa  94.7  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6669  polysaccharide deacetylase  36.67 
 
 
240 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.422259  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
242 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01852  Chitin deacetylasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.41); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BC78]  30.41 
 
 
249 aa  94.4  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  28.49 
 
 
522 aa  94  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  30.88 
 
 
273 aa  94  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  30.99 
 
 
229 aa  94  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3149  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
345 aa  94  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.442211  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0475  polysaccharide deacetylase  34.56 
 
 
336 aa  93.6  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0117021  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  28.83 
 
 
522 aa  92.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 
291 aa  92  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  28.95 
 
 
1154 aa  90.9  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  39.17 
 
 
279 aa  89.7  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 
344 aa  89.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2063  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 
248 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  30.5 
 
 
373 aa  89.4  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
244 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1573  polysaccharide deacetylase  33.77 
 
 
197 aa  89  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  34.88 
 
 
221 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5514  polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 
252 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.77719  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 
1120 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  30.73 
 
 
273 aa  87.4  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  28.12 
 
 
1099 aa  87  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 
752 aa  87  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00270  deacetylase, putative  29.2 
 
 
253 aa  87  7e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1347  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 
196 aa  87  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0921833  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  32.89 
 
 
368 aa  86.7  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  35.83 
 
 
250 aa  85.1  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  27.57 
 
 
273 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  32.79 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  29.38 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  32.85 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  30.27 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  29.24 
 
 
405 aa  83.6  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  32.79 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1037  polysaccharide deacetylase  27.49 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0742911 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  36 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 
275 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1228  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
327 aa  83.2  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  33.71 
 
 
465 aa  82  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  28.19 
 
 
238 aa  82.4  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  28.78 
 
 
294 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  27.96 
 
 
273 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  32.84 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  27.96 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  27.96 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  27.96 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  27.96 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  27.96 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  27.72 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  27.96 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 
404 aa  81.3  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10309  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B3VP78]  26.81 
 
 
467 aa  80.9  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0729219  normal  0.0844633 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  31.36 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  28.65 
 
 
372 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  27.96 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 
372 aa  81.3  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  29.78 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  32.84 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  36.75 
 
 
692 aa  80.9  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  27.57 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>