More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND03580 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND03580  chitin deacetylase, putative  100 
 
 
410 aa  836    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322784  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01800  chitin deacetylase, putative  35.74 
 
 
470 aa  158  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.61842  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03490  chitin deacetylase-like mannoprotein MP98  43.37 
 
 
458 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43807  Chitin deacetylase 2 precursor  36.92 
 
 
269 aa  122  8e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0156185  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  30.05 
 
 
373 aa  103  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  34.86 
 
 
320 aa  96.7  7e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  31.73 
 
 
503 aa  91.3  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0475  polysaccharide deacetylase  33.92 
 
 
336 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0117021  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  29.38 
 
 
292 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0408  peptidoglycan GlcNAc deacetylase  33.16 
 
 
240 aa  89  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  33.87 
 
 
542 aa  87.4  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  40 
 
 
199 aa  87.4  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  33.14 
 
 
352 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 
227 aa  87  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  29 
 
 
258 aa  87  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  32 
 
 
440 aa  87  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  27.7 
 
 
387 aa  82.8  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  36.3 
 
 
299 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
522 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  30.05 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  36.5 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  34.46 
 
 
465 aa  79.7  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  29.8 
 
 
537 aa  79.7  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  30.93 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  32.76 
 
 
692 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  31.61 
 
 
1001 aa  78.2  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  29.5 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  29.27 
 
 
251 aa  77  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  28.93 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0141  polysaccharide deacetylase  29.85 
 
 
216 aa  75.9  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 
307 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  30.29 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  33.53 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 
522 aa  73.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 
520 aa  73.2  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  35.07 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2699  polysaccharide deacetylase  29.12 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000565788  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  27.84 
 
 
273 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1573  polysaccharide deacetylase  31.48 
 
 
197 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 
242 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  28.79 
 
 
488 aa  71.6  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3178  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  27.53 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  31.55 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  33.83 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  30.46 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  28.24 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  31.36 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2063  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  26.2 
 
 
465 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2908  polysaccharide deacetylase  29.61 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.850515  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  31.52 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  28.71 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3061  xylanase/chitin deacetylase-like  32.81 
 
 
767 aa  69.7  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000494565  decreased coverage  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  30.87 
 
 
240 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  26.56 
 
 
344 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  31.3 
 
 
247 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01852  Chitin deacetylasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.41); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BC78]  30.89 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  30.95 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  31.55 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  28.36 
 
 
468 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00270  deacetylase, putative  29.13 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  25.98 
 
 
291 aa  67  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  30.77 
 
 
275 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  34.81 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  31.55 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  29.1 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3196  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase A  28.29 
 
 
280 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.220844  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  25.33 
 
 
258 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  24.55 
 
 
271 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 
405 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  30.14 
 
 
305 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1347  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
196 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0921833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  29.74 
 
 
275 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  35.51 
 
 
302 aa  65.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  26.79 
 
 
241 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3817  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  26.9 
 
 
344 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0327337  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  27.11 
 
 
258 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  31.21 
 
 
321 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  35.07 
 
 
244 aa  63.9  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 
213 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  30.83 
 
 
294 aa  63.9  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  31.85 
 
 
256 aa  64.3  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2070  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  28.57 
 
 
280 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 
213 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 
213 aa  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 
241 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 
213 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  30.07 
 
 
373 aa  63.9  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  26.69 
 
 
1099 aa  63.9  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 
220 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
252 aa  63.9  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  27.33 
 
 
368 aa  63.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5514  polysaccharide deacetylase  34.81 
 
 
252 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.77719  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  31.51 
 
 
241 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>