More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_43807 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_43807  Chitin deacetylase 2 precursor  100 
 
 
269 aa  561  1.0000000000000001e-159  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0156185  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01800  chitin deacetylase, putative  33.05 
 
 
470 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.61842  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03580  chitin deacetylase, putative  36.68 
 
 
410 aa  123  4e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322784  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  38.97 
 
 
503 aa  105  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 
299 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  40.48 
 
 
199 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  32.53 
 
 
542 aa  99.4  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  34.09 
 
 
307 aa  99  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_006686  CND03490  chitin deacetylase-like mannoprotein MP98  32.7 
 
 
458 aa  98.2  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  34.91 
 
 
352 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  30.41 
 
 
468 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  32.95 
 
 
267 aa  96.3  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  34.73 
 
 
301 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  33.13 
 
 
465 aa  95.5  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 
292 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  29.32 
 
 
417 aa  93.6  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  34.67 
 
 
522 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  34.38 
 
 
279 aa  90.5  3e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  33.53 
 
 
320 aa  90.1  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  31.18 
 
 
373 aa  90.1  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  36.3 
 
 
258 aa  90.1  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  35.88 
 
 
287 aa  89.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  36.8 
 
 
227 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  33.07 
 
 
368 aa  87.8  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  28.21 
 
 
256 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 
387 aa  86.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 
275 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  31.13 
 
 
273 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  34.13 
 
 
317 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  31.13 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  31.62 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  31.13 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 
520 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  31.13 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  31.13 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  28.77 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  31.13 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  30.17 
 
 
250 aa  85.1  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  30.46 
 
 
273 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  30.46 
 
 
273 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  32.87 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  32.87 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
276 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  32.87 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  28.25 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  32.87 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6669  polysaccharide deacetylase  33.54 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.422259  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  32.87 
 
 
537 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  34.09 
 
 
373 aa  82.8  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  30.95 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.33 
 
 
251 aa  82  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0408  peptidoglycan GlcNAc deacetylase  34.33 
 
 
240 aa  82  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  34.03 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  32.87 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  32.19 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  35.94 
 
 
204 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  32.77 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  32.84 
 
 
240 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  32.21 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  28.87 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  28.86 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  27.93 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  33.87 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  32.1 
 
 
404 aa  80.1  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  34.03 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0628  polysaccharide deacetylase  31.52 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  30.72 
 
 
1099 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  30.08 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  28.66 
 
 
273 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  34.13 
 
 
242 aa  79  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3196  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase A  32.84 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.220844  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  28.73 
 
 
465 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  28.67 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  28.32 
 
 
413 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  29.19 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  30.47 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  34.11 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  29.49 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 
372 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2063  polysaccharide deacetylase  29.8 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  32.56 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 
789 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 
789 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 
789 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3178  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  32.59 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1585  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1573  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0141  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  32 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01852  Chitin deacetylasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.41); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BC78]  29.74 
 
 
249 aa  75.5  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  31 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  28.42 
 
 
243 aa  75.1  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2943  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.519142  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  29.13 
 
 
522 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  28.19 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2500  polysaccharide deacetylase  32.78 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3449  polysaccharide deacetylase  32.28 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>