More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2943 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2943  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 313 aa  638    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.519142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2500  polysaccharide deacetylase  87.86 
 
 		 311 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3449  polysaccharide deacetylase  83.07 
 
 		 312 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282005  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2107  polysaccharide deacetylase  76.43 
 
 		 310 aa  489  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2343  polysaccharide deacetylase  77.33 
 
 		 322 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1585  polysaccharide deacetylase  72.7 
 
 		 308 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3879  putative polysaccharide deacetylase  79.15 
 
 		 260 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.456812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0282  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  59.14 
 
 		 350 aa  411  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2067  polysaccharide deacetylase  55.85 
 
 		 356 aa  331  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3511  polysaccharide deacetylase  61.45 
 
 		 346 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.269417  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1948  polysaccharide deacetylase  60.92 
 
 		 348 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0425  polysaccharide deacetylase  57.04 
 
 		 345 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1255  polysaccharide deacetylase  58.12 
 
 		 356 aa  315  5e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1576  polysaccharide deacetylase  42.4 
 
 		 307 aa  185  8e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3342  polysaccharide deacetylase  41.63 
 
 		 430 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1620  polysaccharide deacetylase  40.5 
 
 		 321 aa  182  7e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0105344  normal  0.102129 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3341  polysaccharide deacetylase  42.8 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4793  putative polysaccharide deacetylase  41.03 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0697  polysaccharide deacetylase  40.61 
 
 		 297 aa  179  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1710  polysaccharide deacetylase  39.13 
 
 		 427 aa  178  9e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190308  normal  0.343412 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2377  polysaccharide deacetylase  39.38 
 
 		 439 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4083  polysaccharide deacetylase  44.05 
 
 		 270 aa  175  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4792  putative polysaccharide deacetylase  39.69 
 
 		 269 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3575  polysaccharide deacetylase  39.92 
 
 		 439 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2378  polysaccharide deacetylase  42.22 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  42.04 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3077  polysaccharide deacetylase  38.5 
 
 		 440 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00148769  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2435  polysaccharide deacetylase  37.45 
 
 		 428 aa  163  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3076  polysaccharide deacetylase  38.43 
 
 		 265 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112381  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2434  polysaccharide deacetylase  37.55 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1074  polysaccharide deacetylase  42.92 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000250549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1219  polysaccharide deacetylase  38.15 
 
 		 281 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000011337 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  32.85 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  30.29 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  34.24 
 
 		 387 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  36.51 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  31.82 
 
 		 279 aa  102  7e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  32.22 
 
 		 373 aa  102  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  32.42 
 
 		 256 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  32.97 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.25 
 
 		 251 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  31.47 
 
 		 468 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  32.83 
 
 		 267 aa  99.8  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 		 1120 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  35.36 
 
 		 417 aa  99  8e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 		 247 aa  97.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 503 aa  96.3  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  28.91 
 
 		 1124 aa  95.9  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5072  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 		 355 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 		 261 aa  95.5  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  32.79 
 
 		 242 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  33.54 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 		 283 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  34.83 
 
 		 204 aa  93.6  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 372 aa  92.8  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  30.48 
 
 		 488 aa  92.8  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  32.61 
 
 		 373 aa  92.4  8e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  28.86 
 
 		 368 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  30.15 
 
 		 890 aa  90.9  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  30.53 
 
 		 291 aa  90.9  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  29.76 
 
 		 221 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.47 
 
 		 1115 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  31.47 
 
 		 1115 aa  89.7  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  31.47 
 
 		 1119 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.47 
 
 		 1115 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  30.15 
 
 		 898 aa  89.7  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  30.85 
 
 		 275 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  31.72 
 
 		 247 aa  89.4  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 		 302 aa  89  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  30.85 
 
 		 275 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 		 258 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  33.16 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  28.76 
 
 		 522 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  30.34 
 
 		 413 aa  87.4  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 		 227 aa  87  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  25.7 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  30.96 
 
 		 927 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  32.07 
 
 		 241 aa  86.7  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  31.79 
 
 		 244 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 		 199 aa  85.9  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  29.26 
 
 		 275 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.77 
 
 		 1115 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 		 520 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  29.26 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  29.26 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  29.26 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  29.26 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  29.26 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  30.32 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  30.96 
 
 		 872 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2674  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.22 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>