More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0800 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
520 aa  1031    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  40.65 
 
 
537 aa  286  5.999999999999999e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  36.68 
 
 
468 aa  213  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  29.15 
 
 
488 aa  169  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  39.46 
 
 
267 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  31.13 
 
 
503 aa  154  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  41.62 
 
 
307 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  33.44 
 
 
522 aa  139  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  36.22 
 
 
372 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
292 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  36.45 
 
 
247 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  37.98 
 
 
287 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  40.74 
 
 
244 aa  134  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  28.61 
 
 
373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  35 
 
 
417 aa  131  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  37.77 
 
 
305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  35.34 
 
 
320 aa  127  5e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  39.13 
 
 
273 aa  127  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  39.11 
 
 
291 aa  127  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2063  polysaccharide deacetylase  37 
 
 
248 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  35.11 
 
 
258 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  39.55 
 
 
542 aa  125  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 
405 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  38.73 
 
 
247 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  36.65 
 
 
368 aa  123  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
275 aa  123  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  37.19 
 
 
352 aa  123  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  35.52 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  36.22 
 
 
264 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 
276 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
522 aa  121  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  33.51 
 
 
275 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
275 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.86 
 
 
251 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  33.15 
 
 
258 aa  120  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
275 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
275 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
275 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
275 aa  120  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  34.57 
 
 
275 aa  120  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 
277 aa  120  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
275 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  34.97 
 
 
373 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  37.23 
 
 
413 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  32.63 
 
 
221 aa  118  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 
302 aa  117  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.1 
 
 
1115 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  35.1 
 
 
1115 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  35.1 
 
 
1119 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  34.27 
 
 
256 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0935  polysaccharide deacetylase  34.08 
 
 
281 aa  116  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0476216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  35.1 
 
 
927 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  37.02 
 
 
1101 aa  116  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  38.21 
 
 
1118 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 
247 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  34.52 
 
 
324 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  32.8 
 
 
440 aa  114  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.85 
 
 
1115 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  31.72 
 
 
279 aa  114  6e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  31.71 
 
 
244 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  37.3 
 
 
258 aa  113  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
465 aa  113  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.29 
 
 
1115 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
273 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  31.69 
 
 
258 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  27.57 
 
 
261 aa  113  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  35.1 
 
 
872 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 
264 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  35.11 
 
 
228 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
238 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  37.36 
 
 
227 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  36.56 
 
 
250 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  37.57 
 
 
241 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  35.18 
 
 
251 aa  111  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  37.58 
 
 
232 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  34.81 
 
 
404 aa  111  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  33.71 
 
 
295 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  36.65 
 
 
220 aa  110  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  35.6 
 
 
213 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  35.6 
 
 
213 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  35.6 
 
 
213 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  33.82 
 
 
263 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3149  polysaccharide deacetylase  31.75 
 
 
345 aa  109  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.442211  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  33.66 
 
 
317 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  34.85 
 
 
1124 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  35.6 
 
 
241 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 
321 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  35.47 
 
 
1120 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  35.6 
 
 
213 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3178  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  35.75 
 
 
280 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
272 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 
229 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2674  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  35.23 
 
 
250 aa  107  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198792  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 
255 aa  107  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 
256 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  36.65 
 
 
241 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  33.65 
 
 
219 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  36.56 
 
 
217 aa  107  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  32.28 
 
 
345 aa  107  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3076  polysaccharide deacetylase  34.22 
 
 
265 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112381  normal  0.574471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>