More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3076 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3076  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 265 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112381  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2378  polysaccharide deacetylase  78.87 
 
 		 265 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  69.96 
 
 		 267 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3341  polysaccharide deacetylase  63.71 
 
 		 256 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2434  polysaccharide deacetylase  66.24 
 
 		 293 aa  321  6e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4792  putative polysaccharide deacetylase  60.87 
 
 		 269 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0697  polysaccharide deacetylase  53.47 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4083  polysaccharide deacetylase  56.22 
 
 		 270 aa  236  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1620  polysaccharide deacetylase  51.75 
 
 		 321 aa  215  7e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0105344  normal  0.102129 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3575  polysaccharide deacetylase  43.9 
 
 		 439 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3342  polysaccharide deacetylase  43.2 
 
 		 430 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1710  polysaccharide deacetylase  42.97 
 
 		 427 aa  189  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190308  normal  0.343412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3077  polysaccharide deacetylase  41.67 
 
 		 440 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00148769  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2377  polysaccharide deacetylase  43.16 
 
 		 439 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2435  polysaccharide deacetylase  43.35 
 
 		 428 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4793  putative polysaccharide deacetylase  39.92 
 
 		 393 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0425  polysaccharide deacetylase  41.56 
 
 		 345 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3449  polysaccharide deacetylase  38.16 
 
 		 312 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282005  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2943  polysaccharide deacetylase  38.5 
 
 		 313 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.519142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2500  polysaccharide deacetylase  36.73 
 
 		 311 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1255  polysaccharide deacetylase  38.67 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2067  polysaccharide deacetylase  36.89 
 
 		 356 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1948  polysaccharide deacetylase  37.12 
 
 		 348 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2343  polysaccharide deacetylase  37.95 
 
 		 322 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2107  polysaccharide deacetylase  37.67 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0282  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  36.84 
 
 		 350 aa  148  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3511  polysaccharide deacetylase  37.78 
 
 		 346 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.269417  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3879  putative polysaccharide deacetylase  37.39 
 
 		 260 aa  145  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.456812 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1585  polysaccharide deacetylase  34.96 
 
 		 308 aa  144  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1576  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1074  polysaccharide deacetylase  36.14 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000250549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1219  polysaccharide deacetylase  35.82 
 
 		 281 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000011337 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  34.22 
 
 		 520 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  33.96 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  35.2 
 
 		 387 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  35.11 
 
 		 352 aa  99  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 		 273 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 		 273 aa  97.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 		 273 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 		 273 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 		 273 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  31.85 
 
 		 273 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  31.22 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  30.98 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  33.2 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  32.45 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 		 503 aa  94.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  34.76 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  32.81 
 
 		 522 aa  94  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  32.4 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 		 413 aa  93.2  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  33.02 
 
 		 243 aa  92.8  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  31.75 
 
 		 273 aa  93.2  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  42.66 
 
 		 275 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  42.66 
 
 		 275 aa  92.8  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  42.66 
 
 		 275 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  35.93 
 
 		 301 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  42.66 
 
 		 275 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  41.43 
 
 		 275 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  41.43 
 
 		 275 aa  92  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  31.75 
 
 		 275 aa  92  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  41.43 
 
 		 276 aa  92  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  41.43 
 
 		 275 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  42.55 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  28.86 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2294  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923024  unclonable  2.97243e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  42.66 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  30.69 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  30.69 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  30.24 
 
 		 1118 aa  90.5  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  29.9 
 
 		 373 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  35.59 
 
 		 242 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  32.34 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  32.28 
 
 		 221 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 292 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  35.05 
 
 		 537 aa  89  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  34.4 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 		 275 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  31.38 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  34.17 
 
 		 1124 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 		 324 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  31.48 
 
 		 1101 aa  87.4  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2736  polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 		 275 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000182255  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  31.72 
 
 		 417 aa  86.7  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  34.02 
 
 		 468 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  32.11 
 
 		 204 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  36.69 
 
 		 242 aa  85.9  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  32.42 
 
 		 262 aa  85.5  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 		 283 aa  85.5  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>