More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2435 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2435  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
428 aa  865    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1710  polysaccharide deacetylase  72.09 
 
 
427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190308  normal  0.343412 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3342  polysaccharide deacetylase  66.94 
 
 
430 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313292  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2377  polysaccharide deacetylase  63.66 
 
 
439 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3575  polysaccharide deacetylase  60.24 
 
 
439 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3077  polysaccharide deacetylase  63.54 
 
 
440 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00148769  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4793  putative polysaccharide deacetylase  54.67 
 
 
393 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4083  polysaccharide deacetylase  46.78 
 
 
270 aa  203  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32938  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4792  putative polysaccharide deacetylase  48.12 
 
 
269 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0697  polysaccharide deacetylase  48.23 
 
 
297 aa  195  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3341  polysaccharide deacetylase  47.5 
 
 
256 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732984  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3076  polysaccharide deacetylase  43.78 
 
 
265 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112381  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2434  polysaccharide deacetylase  44.07 
 
 
293 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2378  polysaccharide deacetylase  42.11 
 
 
265 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  42.24 
 
 
267 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1620  polysaccharide deacetylase  38.38 
 
 
321 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0105344  normal  0.102129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0282  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  42.73 
 
 
350 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347733  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3511  polysaccharide deacetylase  40.91 
 
 
346 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.269417  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1948  polysaccharide deacetylase  40.45 
 
 
348 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2343  polysaccharide deacetylase  38.94 
 
 
322 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2067  polysaccharide deacetylase  39.82 
 
 
356 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1576  polysaccharide deacetylase  41.63 
 
 
307 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2500  polysaccharide deacetylase  38.5 
 
 
311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2943  polysaccharide deacetylase  37.71 
 
 
313 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.519142  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2107  polysaccharide deacetylase  40.17 
 
 
310 aa  167  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1255  polysaccharide deacetylase  38.46 
 
 
356 aa  166  9e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1585  polysaccharide deacetylase  37.99 
 
 
308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3879  putative polysaccharide deacetylase  38.81 
 
 
260 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.456812 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0425  polysaccharide deacetylase  38.16 
 
 
345 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3449  polysaccharide deacetylase  36.73 
 
 
312 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282005  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1219  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 
281 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000011337 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1074  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000250549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  31.98 
 
 
321 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  36.51 
 
 
320 aa  105  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  34.59 
 
 
285 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  37.97 
 
 
503 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 
272 aa  97.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
305 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 
273 aa  94.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  29.9 
 
 
251 aa  93.6  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  28.7 
 
 
273 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
217 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 
273 aa  92.8  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  33.16 
 
 
244 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 
220 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  34.5 
 
 
352 aa  92  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
273 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
273 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
273 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
273 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
273 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  32.8 
 
 
417 aa  91.7  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  33.65 
 
 
752 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  30.27 
 
 
273 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 
213 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 
213 aa  90.9  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 
213 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  32.63 
 
 
275 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  28.51 
 
 
300 aa  90.9  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  32.46 
 
 
275 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  29.96 
 
 
273 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  31.44 
 
 
373 aa  90.5  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 
241 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 
273 aa  90.1  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 
275 aa  90.1  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 
241 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  32.98 
 
 
275 aa  90.1  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  32.98 
 
 
275 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 
213 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 
275 aa  90.1  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 
275 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
275 aa  90.1  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  33.16 
 
 
241 aa  90.1  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 
275 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  29.52 
 
 
273 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 
215 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2294  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 
260 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923024  unclonable  2.97243e-26 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  28.34 
 
 
273 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  35.38 
 
 
267 aa  89  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  32.65 
 
 
241 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  31.72 
 
 
387 aa  87  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 
302 aa  87  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  31.66 
 
 
217 aa  87  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 
1002 aa  86.3  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 
1120 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  31.68 
 
 
1115 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  31.68 
 
 
1119 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.68 
 
 
1115 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
258 aa  85.9  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2736  polysaccharide deacetylase  32.31 
 
 
275 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000182255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  31.68 
 
 
927 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 
273 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  30.11 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  32.81 
 
 
413 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  30.37 
 
 
465 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3178  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  26 
 
 
280 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  36.93 
 
 
283 aa  84.7  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  32.63 
 
 
404 aa  84  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 
425 aa  84  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>