More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2343 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2343  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 322 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2500  polysaccharide deacetylase  76.4 
 
 		 311 aa  497  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2943  polysaccharide deacetylase  78.26 
 
 		 313 aa  497  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.519142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3449  polysaccharide deacetylase  77.02 
 
 		 312 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282005  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2107  polysaccharide deacetylase  73.29 
 
 		 310 aa  484  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1585  polysaccharide deacetylase  69.57 
 
 		 308 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3879  putative polysaccharide deacetylase  75.29 
 
 		 260 aa  418  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.456812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0282  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  59.26 
 
 		 350 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0425  polysaccharide deacetylase  54.79 
 
 		 345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3511  polysaccharide deacetylase  58.4 
 
 		 346 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.269417  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1948  polysaccharide deacetylase  56.92 
 
 		 348 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2067  polysaccharide deacetylase  55.73 
 
 		 356 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1255  polysaccharide deacetylase  55.43 
 
 		 356 aa  305  9.000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4793  putative polysaccharide deacetylase  41.77 
 
 		 393 aa  182  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1710  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 427 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190308  normal  0.343412 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3341  polysaccharide deacetylase  42.28 
 
 		 256 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1576  polysaccharide deacetylase  41.01 
 
 		 307 aa  179  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3575  polysaccharide deacetylase  39.36 
 
 		 439 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2377  polysaccharide deacetylase  38.94 
 
 		 439 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3342  polysaccharide deacetylase  38.43 
 
 		 430 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1620  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0105344  normal  0.102129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0697  polysaccharide deacetylase  39.56 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3077  polysaccharide deacetylase  38.96 
 
 		 440 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00148769  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2378  polysaccharide deacetylase  40.53 
 
 		 265 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4792  putative polysaccharide deacetylase  40.27 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4083  polysaccharide deacetylase  40.76 
 
 		 270 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2435  polysaccharide deacetylase  38.3 
 
 		 428 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  38.6 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2434  polysaccharide deacetylase  37.99 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3076  polysaccharide deacetylase  38.16 
 
 		 265 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112381  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1074  polysaccharide deacetylase  36.17 
 
 		 280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000250549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1219  polysaccharide deacetylase  35.61 
 
 		 281 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000011337 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 		 354 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  32.17 
 
 		 352 aa  106  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.85 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  32.09 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  32.97 
 
 		 324 aa  102  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  35.4 
 
 		 299 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  32.08 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  33.52 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  31.23 
 
 		 277 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 		 1120 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  34.24 
 
 		 373 aa  99  9e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  34.54 
 
 		 267 aa  98.6  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 		 247 aa  97.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  36.61 
 
 		 417 aa  97.4  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  36.9 
 
 		 204 aa  97.1  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 242 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  31.11 
 
 		 373 aa  95.9  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.99 
 
 		 1115 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  32.99 
 
 		 1115 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  32.99 
 
 		 1119 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  30.96 
 
 		 468 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  33.54 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  32.09 
 
 		 503 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 		 283 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.99 
 
 		 1115 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  29.61 
 
 		 898 aa  93.2  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  32.61 
 
 		 387 aa  92.8  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  34.04 
 
 		 261 aa  92  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  32.49 
 
 		 927 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  30.37 
 
 		 368 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  29.55 
 
 		 890 aa  91.3  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 		 320 aa  90.5  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  35.53 
 
 		 244 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.31 
 
 		 1115 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  32.09 
 
 		 488 aa  90.1  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  32.02 
 
 		 413 aa  90.5  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  30.37 
 
 		 258 aa  88.6  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 		 871 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  33.69 
 
 		 227 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  31.71 
 
 		 247 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  30.73 
 
 		 221 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  32.49 
 
 		 872 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  29.67 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 		 372 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  30.3 
 
 		 1124 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 		 263 aa  86.3  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  32.17 
 
 		 275 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 		 275 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  31.91 
 
 		 275 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 		 199 aa  85.5  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  30.61 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  33.88 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  34.07 
 
 		 256 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  29.56 
 
 		 573 aa  84.7  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01940  predicted xylanase/chitin deacetylase  32.2 
 
 		 571 aa  85.1  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000016994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  31.18 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  31.74 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  31.74 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  31.74 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  30.51 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  31.74 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  31.74 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  31.74 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  31.62 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  30.32 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>