More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2434 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2434  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 293 aa  601  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3341  polysaccharide deacetylase  69.14 
 
 		 256 aa  346  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3076  polysaccharide deacetylase  66.24 
 
 		 265 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112381  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2378  polysaccharide deacetylase  67.25 
 
 		 265 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  64.05 
 
 		 267 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4792  putative polysaccharide deacetylase  61.6 
 
 		 269 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4083  polysaccharide deacetylase  57.26 
 
 		 270 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0697  polysaccharide deacetylase  53.64 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1620  polysaccharide deacetylase  51.93 
 
 		 321 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0105344  normal  0.102129 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1710  polysaccharide deacetylase  44.63 
 
 		 427 aa  186  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190308  normal  0.343412 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2377  polysaccharide deacetylase  45.26 
 
 		 439 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3575  polysaccharide deacetylase  41.73 
 
 		 439 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3342  polysaccharide deacetylase  44.12 
 
 		 430 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3077  polysaccharide deacetylase  43.59 
 
 		 440 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00148769  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2435  polysaccharide deacetylase  44.07 
 
 		 428 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4793  putative polysaccharide deacetylase  42.62 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0425  polysaccharide deacetylase  40.87 
 
 		 345 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2067  polysaccharide deacetylase  37.89 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2500  polysaccharide deacetylase  36.99 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3449  polysaccharide deacetylase  38.43 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282005  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2943  polysaccharide deacetylase  38.12 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.519142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1948  polysaccharide deacetylase  38.43 
 
 		 348 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3511  polysaccharide deacetylase  38.63 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.269417  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1255  polysaccharide deacetylase  39.29 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2107  polysaccharide deacetylase  38.57 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2343  polysaccharide deacetylase  38.57 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0282  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  39.82 
 
 		 350 aa  155  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1576  polysaccharide deacetylase  38.96 
 
 		 307 aa  155  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1585  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 		 308 aa  152  8e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3879  putative polysaccharide deacetylase  39.45 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.456812 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1074  polysaccharide deacetylase  36.13 
 
 		 280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000250549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1219  polysaccharide deacetylase  35.08 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000011337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  34.16 
 
 		 413 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0065  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 		 365 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00184975  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 261 aa  93.2  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 		 503 aa  90.1  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  31.9 
 
 		 405 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4011  polysaccharide deacetylase  35.79 
 
 		 360 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  31.38 
 
 		 520 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  36.18 
 
 		 1124 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  32.86 
 
 		 387 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  34.57 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  29.29 
 
 		 279 aa  86.7  4e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  34.04 
 
 		 324 aa  86.3  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  31.91 
 
 		 468 aa  85.9  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  30.73 
 
 		 890 aa  85.5  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 		 256 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  29.2 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  30.6 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  27.59 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 		 898 aa  84  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  29.21 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  32.65 
 
 		 440 aa  83.2  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  31.89 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  31.18 
 
 		 417 aa  82.8  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  32.02 
 
 		 683 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  32.26 
 
 		 488 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  30.85 
 
 		 1115 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  30.85 
 
 		 1119 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  27.66 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.85 
 
 		 1115 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  28.12 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  30.85 
 
 		 927 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.85 
 
 		 1115 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  32.29 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 522 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  29.89 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.85 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  30.89 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  29.81 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  33.73 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  27.73 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  27.6 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  32.12 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 522 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  34.06 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  31.12 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.85 
 
 		 1115 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  36.07 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  30.5 
 
 		 1101 aa  76.6  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  28.77 
 
 		 1154 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1625  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679944  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  34.06 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  34.06 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  34.06 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 413 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  30.85 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  34.06 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0141  polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>