More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1620 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1620  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
321 aa  650    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0105344  normal  0.102129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0697  polysaccharide deacetylase  60.8 
 
 
297 aa  316  3e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4083  polysaccharide deacetylase  58.11 
 
 
270 aa  260  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32938  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2434  polysaccharide deacetylase  51.93 
 
 
293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4792  putative polysaccharide deacetylase  49.35 
 
 
269 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3341  polysaccharide deacetylase  50.23 
 
 
256 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732984  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3076  polysaccharide deacetylase  51.75 
 
 
265 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112381  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2378  polysaccharide deacetylase  47.83 
 
 
265 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  46.72 
 
 
267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2067  polysaccharide deacetylase  41.18 
 
 
356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3511  polysaccharide deacetylase  41.57 
 
 
346 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.269417  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1948  polysaccharide deacetylase  41.99 
 
 
348 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0425  polysaccharide deacetylase  40.34 
 
 
345 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2943  polysaccharide deacetylase  42.27 
 
 
313 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.519142  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2377  polysaccharide deacetylase  40.16 
 
 
439 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1710  polysaccharide deacetylase  41.35 
 
 
427 aa  179  7e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190308  normal  0.343412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3077  polysaccharide deacetylase  40.08 
 
 
440 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00148769  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3342  polysaccharide deacetylase  38.06 
 
 
430 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313292  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3449  polysaccharide deacetylase  40.69 
 
 
312 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282005  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1576  polysaccharide deacetylase  42.67 
 
 
307 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2343  polysaccharide deacetylase  40 
 
 
322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2500  polysaccharide deacetylase  39.55 
 
 
311 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0282  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  40.26 
 
 
350 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347733  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2435  polysaccharide deacetylase  38.03 
 
 
428 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3879  putative polysaccharide deacetylase  40 
 
 
260 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.456812 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2107  polysaccharide deacetylase  40 
 
 
310 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1585  polysaccharide deacetylase  39.09 
 
 
308 aa  169  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1255  polysaccharide deacetylase  37.25 
 
 
356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3575  polysaccharide deacetylase  37.35 
 
 
439 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4793  putative polysaccharide deacetylase  39.37 
 
 
393 aa  159  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1074  polysaccharide deacetylase  35.62 
 
 
280 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000250549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1219  polysaccharide deacetylase  36.22 
 
 
281 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000011337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  36.97 
 
 
1124 aa  106  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  35.51 
 
 
413 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  36.65 
 
 
387 aa  99.4  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  34.09 
 
 
1120 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  31.41 
 
 
305 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  30.95 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  36 
 
 
1101 aa  94.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.59 
 
 
1115 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  32.83 
 
 
320 aa  93.6  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  34.91 
 
 
301 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 
275 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  30.84 
 
 
927 aa  92.4  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  34.9 
 
 
256 aa  92.4  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  30.84 
 
 
1115 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  30.84 
 
 
1119 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.84 
 
 
1115 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  30.84 
 
 
872 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  34.51 
 
 
413 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.31 
 
 
1115 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  33.78 
 
 
752 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 
259 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 
275 aa  89.7  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 
275 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 
275 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 
275 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  35.54 
 
 
299 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.79 
 
 
251 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 
241 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 
1118 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  32.44 
 
 
430 aa  88.6  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  36.56 
 
 
267 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 
213 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 
213 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 
213 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 
220 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
1002 aa  89  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  34.2 
 
 
275 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  34.2 
 
 
275 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 
275 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  34.93 
 
 
246 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 
213 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 
241 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 
275 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 
275 aa  87  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  31.16 
 
 
302 aa  87.4  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  34.74 
 
 
227 aa  86.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 
276 aa  87  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  30.36 
 
 
273 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
324 aa  86.3  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2294  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 
260 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923024  unclonable  2.97243e-26 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  34.67 
 
 
352 aa  86.3  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  31.61 
 
 
275 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2736  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 
275 aa  85.9  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000182255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 
275 aa  85.9  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  31.61 
 
 
275 aa  85.9  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 
275 aa  85.9  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 
275 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 
275 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  33.67 
 
 
241 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 
275 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  31.09 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  28.5 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  32.63 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  34.74 
 
 
404 aa  85.1  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>