More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2377 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2377  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 439 aa  882    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3077  polysaccharide deacetylase  78.86 
 
 		 440 aa  687    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00148769  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3575  polysaccharide deacetylase  67.73 
 
 		 439 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3342  polysaccharide deacetylase  65.95 
 
 		 430 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2435  polysaccharide deacetylase  60.52 
 
 		 428 aa  479  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1710  polysaccharide deacetylase  57.91 
 
 		 427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190308  normal  0.343412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4793  putative polysaccharide deacetylase  58.59 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4792  putative polysaccharide deacetylase  49.17 
 
 		 269 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4083  polysaccharide deacetylase  47.48 
 
 		 270 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0697  polysaccharide deacetylase  43.41 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3341  polysaccharide deacetylase  46.28 
 
 		 256 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3076  polysaccharide deacetylase  42.28 
 
 		 265 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112381  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2434  polysaccharide deacetylase  45.34 
 
 		 293 aa  187  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0282  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  42.92 
 
 		 350 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1620  polysaccharide deacetylase  40.16 
 
 		 321 aa  179  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0105344  normal  0.102129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3879  putative polysaccharide deacetylase  39.73 
 
 		 260 aa  179  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.456812 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2378  polysaccharide deacetylase  42.92 
 
 		 265 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2943  polysaccharide deacetylase  39.38 
 
 		 313 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.519142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2107  polysaccharide deacetylase  39.92 
 
 		 310 aa  176  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1576  polysaccharide deacetylase  42.58 
 
 		 307 aa  176  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  43.1 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0425  polysaccharide deacetylase  40.27 
 
 		 345 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2343  polysaccharide deacetylase  38.94 
 
 		 322 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2500  polysaccharide deacetylase  38.5 
 
 		 311 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3511  polysaccharide deacetylase  41.36 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.269417  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3449  polysaccharide deacetylase  38.46 
 
 		 312 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282005  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1948  polysaccharide deacetylase  39.55 
 
 		 348 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2067  polysaccharide deacetylase  40.27 
 
 		 356 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1585  polysaccharide deacetylase  37.99 
 
 		 308 aa  169  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1255  polysaccharide deacetylase  38.01 
 
 		 356 aa  168  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1074  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000250549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1219  polysaccharide deacetylase  32.08 
 
 		 281 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000011337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  34.59 
 
 		 285 aa  106  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  31.96 
 
 		 373 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  34.57 
 
 		 320 aa  100  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  30.13 
 
 		 324 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  31.15 
 
 		 890 aa  98.2  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 		 321 aa  98.2  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  32.8 
 
 		 417 aa  97.4  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 		 305 aa  97.1  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  28.81 
 
 		 279 aa  97.1  6e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  30.48 
 
 		 275 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.96 
 
 		 251 aa  96.7  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 		 275 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 		 275 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 		 275 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  31.02 
 
 		 275 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  39.04 
 
 		 259 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  31.02 
 
 		 275 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 		 275 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  32.11 
 
 		 272 aa  96.3  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  35.11 
 
 		 204 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 		 387 aa  95.9  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 		 275 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  31.75 
 
 		 273 aa  95.1  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  36.56 
 
 		 503 aa  94  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2736  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 		 275 aa  94  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000182255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2294  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 260 aa  94  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923024  unclonable  2.97243e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  32.29 
 
 		 273 aa  94  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 		 275 aa  94  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  32.32 
 
 		 301 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  27.97 
 
 		 273 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  31.16 
 
 		 302 aa  92.8  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  28.63 
 
 		 273 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  27.49 
 
 		 903 aa  92.4  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  27.59 
 
 		 273 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  28.17 
 
 		 900 aa  92.4  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  27.97 
 
 		 273 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  27.97 
 
 		 273 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  27.97 
 
 		 273 aa  91.7  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  29.1 
 
 		 273 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  27.97 
 
 		 273 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  27.97 
 
 		 273 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  27.97 
 
 		 273 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 217 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  32.11 
 
 		 273 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  29.08 
 
 		 1120 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  33.5 
 
 		 244 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  31.87 
 
 		 299 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  36.46 
 
 		 273 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 		 213 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 		 213 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 		 277 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 		 213 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  35.57 
 
 		 272 aa  89.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 		 220 aa  89  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  30.35 
 
 		 898 aa  89  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 		 244 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 300 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 		 241 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  32.23 
 
 		 789 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  32.23 
 
 		 789 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  32.23 
 
 		 789 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  32.49 
 
 		 213 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  35.33 
 
 		 229 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  35.03 
 
 		 352 aa  87  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  30.11 
 
 		 292 aa  87  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  31.63 
 
 		 241 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  29.59 
 
 		 368 aa  86.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>