More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2313 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  57.06 
 
 		 890 aa  995    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  55.15 
 
 		 898 aa  972    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  96.46 
 
 		 900 aa  1759    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  100 
 
 		 903 aa  1861    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  39.24 
 
 		 871 aa  588  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.55 
 
 		 658 aa  157  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.53 
 
 		 590 aa  131  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  30.73 
 
 		 368 aa  113  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 229 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.88 
 
 		 477 aa  107  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  31.25 
 
 		 279 aa  105  5e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 		 199 aa  102  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.66 
 
 		 428 aa  102  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  34.74 
 
 		 273 aa  100  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  30.32 
 
 		 211 aa  100  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  34.67 
 
 		 465 aa  100  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 299 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 		 273 aa  99  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  25.66 
 
 		 442 aa  99  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  30 
 
 		 373 aa  98.6  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  31.77 
 
 		 417 aa  98.2  7e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 		 405 aa  98.2  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 217 aa  97.8  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  37.27 
 
 		 273 aa  97.4  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 352 aa  96.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1219  polysaccharide deacetylase  31.16 
 
 		 281 aa  96.3  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000011337 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  36.74 
 
 		 273 aa  96.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  36.74 
 
 		 273 aa  96.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  36.74 
 
 		 273 aa  96.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  36.74 
 
 		 273 aa  96.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  36.74 
 
 		 273 aa  96.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3342  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 430 aa  96.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  36.74 
 
 		 273 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  33.16 
 
 		 287 aa  97.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 		 283 aa  95.9  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 522 aa  96.3  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  32.63 
 
 		 468 aa  95.9  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 301 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  37.33 
 
 		 272 aa  95.9  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 503 aa  95.1  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 		 387 aa  95.1  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  27.6 
 
 		 291 aa  95.1  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 		 261 aa  94.7  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  30.24 
 
 		 212 aa  94.7  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  33.64 
 
 		 273 aa  94.4  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  36.28 
 
 		 273 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0425  polysaccharide deacetylase  29.53 
 
 		 345 aa  94  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1074  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 		 280 aa  93.6  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000250549 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  36.28 
 
 		 273 aa  94  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  31.44 
 
 		 373 aa  94  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3575  polysaccharide deacetylase  31.54 
 
 		 439 aa  93.2  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  30.1 
 
 		 364 aa  93.2  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  33.51 
 
 		 244 aa  93.2  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  29.27 
 
 		 256 aa  93.2  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  30.32 
 
 		 324 aa  92.8  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2377  polysaccharide deacetylase  27.49 
 
 		 439 aa  92.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 		 285 aa  92.4  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 		 321 aa  91.7  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  31.75 
 
 		 317 aa  91.3  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  32.87 
 
 		 273 aa  91.3  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  31.07 
 
 		 1099 aa  91.3  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 255 aa  91.3  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5072  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 		 355 aa  90.5  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  30.48 
 
 		 542 aa  89.7  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  32.39 
 
 		 232 aa  90.1  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2699  polysaccharide deacetylase  31.1 
 
 		 274 aa  89  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000565788  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 		 413 aa  89  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3077  polysaccharide deacetylase  26.12 
 
 		 440 aa  89  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00148769  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  28.86 
 
 		 258 aa  88.2  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  30.99 
 
 		 479 aa  88.2  7e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  28.87 
 
 		 465 aa  87.8  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  27.75 
 
 		 294 aa  87  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3669  polysaccharide deacetylase  26.7 
 
 		 250 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  33.8 
 
 		 275 aa  87  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  35.98 
 
 		 273 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  33.8 
 
 		 275 aa  87  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3747  polysaccharide deacetylase  29.87 
 
 		 245 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000014318  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  33.8 
 
 		 275 aa  87  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  27.14 
 
 		 204 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 219 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4793  putative polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 		 393 aa  87  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  34.58 
 
 		 275 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  33.8 
 
 		 275 aa  87  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  33.8 
 
 		 275 aa  87  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 		 372 aa  86.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  33.8 
 
 		 275 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  30.24 
 
 		 215 aa  85.9  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  31.77 
 
 		 242 aa  85.9  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2736  polysaccharide deacetylase  34.16 
 
 		 275 aa  85.9  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000182255  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  29.8 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  33.18 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  31.34 
 
 		 1115 aa  85.1  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  31.34 
 
 		 1119 aa  85.1  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.34 
 
 		 1115 aa  85.1  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  29.86 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  29.56 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2067  polysaccharide deacetylase  27.84 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  29.76 
 
 		 213 aa  84  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>