More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2898 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
428 aa  882    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  64.52 
 
 
442 aa  524  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.92 
 
 
464 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  31.7 
 
 
898 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0721  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.83 
 
 
696 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 
890 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3027  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.56 
 
 
697 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.438464  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  25.66 
 
 
900 aa  105  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.77 
 
 
1686 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  25.66 
 
 
903 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  28.24 
 
 
871 aa  93.6  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.2 
 
 
261 aa  90.9  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.368497 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  39.01 
 
 
1156 aa  88.6  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  35.83 
 
 
1585 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  29.84 
 
 
821 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  42.5 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.39 
 
 
658 aa  84  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.15 
 
 
1760 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  33.93 
 
 
870 aa  81.6  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3477  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.63 
 
 
830 aa  80.9  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814329  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  35.84 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4542  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
795 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4451  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
795 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.77 
 
 
1343 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  40.5 
 
 
469 aa  77.4  0.0000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  40.34 
 
 
2413 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1153  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.59 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206114  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0395  Ankyrin  36.09 
 
 
640 aa  75.9  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  38.79 
 
 
1402 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  35.59 
 
 
750 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  42.06 
 
 
756 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  38.98 
 
 
762 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5125  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.83 
 
 
469 aa  73.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.499707  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0230  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.13 
 
 
355 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0337671 
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  34.75 
 
 
954 aa  72.4  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  37.29 
 
 
329 aa  72.8  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0418  Ankyrin  39.83 
 
 
544 aa  72.8  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4110  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.27 
 
 
729 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  38.32 
 
 
483 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0766  ankyrin repeat-containing protein  38.84 
 
 
474 aa  71.6  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.705844  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
1711 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  32.2 
 
 
855 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  32.12 
 
 
731 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08550  ankyrin repeat-containing protein  39.09 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454701 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.63 
 
 
1004 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08085  conserved hypothetical protein  40 
 
 
1021 aa  70.5  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130443  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  28.85 
 
 
1030 aa  70.1  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_9151  predicted protein  34.13 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00609094  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3217  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.46 
 
 
531 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.86766  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  35.34 
 
 
490 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1865  hypothetical protein  34.75 
 
 
138 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000370925 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0104  ankyrin  35.77 
 
 
151 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.67 
 
 
1088 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  36.97 
 
 
1005 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2058  hypothetical protein  30 
 
 
951 aa  68.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  38.32 
 
 
891 aa  68.2  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2208  Ankyrin  29.17 
 
 
144 aa  68.2  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00294118  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1229  hypothetical protein  36.28 
 
 
1249 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0154751 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  35.51 
 
 
404 aa  67.4  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  37.5 
 
 
723 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  39.42 
 
 
450 aa  66.6  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3148  Ankyrin  33.59 
 
 
581 aa  66.6  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.83 
 
 
841 aa  66.6  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  31.52 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2498  ankyrin  36.13 
 
 
479 aa  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00214  conserved hypothetical protein  38.18 
 
 
321 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574203  normal  0.267859 
 
 
-
 
NC_002978  WD0291  ankyrin repeat-containing prophage LambdaW1  30.77 
 
 
224 aa  66.2  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.461089  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1384  ankyrin  32.69 
 
 
235 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309496  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2760  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.03 
 
 
393 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00577911  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1250  ankyrin  35.4 
 
 
144 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  37.96 
 
 
494 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3392  ankyrin  37.21 
 
 
247 aa  65.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097583 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1952  ankyrin  38.68 
 
 
223 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0636  hypothetical protein  33.86 
 
 
545 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  37.38 
 
 
483 aa  65.5  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02100  conserved hypothetical protein  32.24 
 
 
1226 aa  65.5  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.69 
 
 
309 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1827  ankyrin  42.67 
 
 
236 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0395685  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1799  ankyrin  42.67 
 
 
236 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.912311 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2066  Ankyrin  35.04 
 
 
324 aa  64.7  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000116575  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00782  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_1G14510)  31.54 
 
 
1139 aa  64.3  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2058  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.47 
 
 
324 aa  64.3  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0306404  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1890  ankyrin repeat-containing protein  43.84 
 
 
236 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0277934  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1913  ankyrin repeat-containing protein  43.84 
 
 
236 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0270531 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0270  ankyrin  34.15 
 
 
445 aa  63.9  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6189  ankyrin repeat-containing protein  43.84 
 
 
236 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2199  ankyrin repeat-containing protein  32.64 
 
 
442 aa  63.9  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  34.75 
 
 
1061 aa  63.5  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  30.13 
 
 
347 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2158  ankyrin repeat-containing protein  42.67 
 
 
240 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28 
 
 
843 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1421  ankyrin repeat-containing protein  41.33 
 
 
235 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.89673  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2277  ankyrin repeat-containing protein  41.33 
 
 
240 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1912  ankyrin repeat-containing protein  41.33 
 
 
235 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4159  ankyrin repeat-containing protein  32.77 
 
 
145 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0002  ankyrin  40.54 
 
 
578 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.216352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2316  ankyrin repeat-containing protein  41.33 
 
 
242 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3392  ankyrin repeat-containing protein  41.33 
 
 
235 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  27.41 
 
 
1619 aa  62.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1185  ankyrin repeat-containing protein  41.33 
 
 
235 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>