128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2378 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
658 aa  1353    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  38.55 
 
 
871 aa  182  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  40.39 
 
 
898 aa  170  8e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  38.82 
 
 
890 aa  168  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  37.96 
 
 
900 aa  159  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  37.55 
 
 
903 aa  157  6e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.8 
 
 
464 aa  103  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
477 aa  99.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.22 
 
 
590 aa  97.4  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  28.91 
 
 
442 aa  92.8  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2058  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.81 
 
 
324 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0306404  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.39 
 
 
428 aa  84.3  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3477  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.58 
 
 
830 aa  83.6  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814329  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.13 
 
 
1004 aa  74.7  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  27.16 
 
 
781 aa  74.3  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  26.75 
 
 
636 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.82 
 
 
324 aa  72  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.15 
 
 
1686 aa  70.9  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2760  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.91 
 
 
393 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00577911  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.59 
 
 
1088 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4662  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.92 
 
 
322 aa  68.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  27.52 
 
 
1097 aa  68.2  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.12 
 
 
501 aa  68.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  29.88 
 
 
587 aa  67.4  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  32.82 
 
 
664 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1053  GUN4 domain protein  27.17 
 
 
670 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0234472 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2413  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.75 
 
 
579 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588037  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.14 
 
 
485 aa  64.3  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3011  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.41 
 
 
466 aa  63.9  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.912982  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.81 
 
 
295 aa  63.5  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
309 aa  63.9  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1545  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.33 
 
 
578 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.33 
 
 
578 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0185927  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.34 
 
 
292 aa  61.6  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1153  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.49 
 
 
278 aa  60.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206114  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.08 
 
 
502 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1560  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 
316 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  24.46 
 
 
500 aa  58.9  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0722  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.87 
 
 
324 aa  58.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2534  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.26 
 
 
941 aa  58.5  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.687385  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  26.19 
 
 
654 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0055  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.11 
 
 
316 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000868193  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.02 
 
 
499 aa  57.4  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.15 
 
 
1711 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0028  hypothetical protein  25.87 
 
 
331 aa  56.2  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.194493 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.97 
 
 
1004 aa  56.6  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.7 
 
 
515 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4686  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.66 
 
 
289 aa  55.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0721  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.39 
 
 
696 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2371  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.62 
 
 
561 aa  55.1  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3616  hypothetical protein  30.96 
 
 
328 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666747  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4190  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 
265 aa  55.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.63 
 
 
478 aa  54.7  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0868  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.55 
 
 
1106 aa  54.3  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63918  predicted protein  30.82 
 
 
378 aa  54.3  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  22.78 
 
 
576 aa  54.3  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3611  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.5 
 
 
649 aa  53.9  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4852  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.52 
 
 
766 aa  53.9  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.771827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0189  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.18 
 
 
313 aa  53.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4626  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.16 
 
 
291 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  24.58 
 
 
1619 aa  53.9  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2362  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.11 
 
 
630 aa  53.5  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.03 
 
 
1760 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.71 
 
 
511 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.97 
 
 
497 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.43 
 
 
421 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.28 
 
 
457 aa  52  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168227 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0230  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.81 
 
 
355 aa  52.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0337671 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0784  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.85 
 
 
291 aa  52  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0960  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.5 
 
 
862 aa  51.6  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.355322  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0548  putative peptidase  24.88 
 
 
287 aa  51.6  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.26 
 
 
1316 aa  51.6  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.48 
 
 
1481 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.18 
 
 
486 aa  51.6  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2750  hypothetical protein  37.14 
 
 
615 aa  51.2  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.2 
 
 
657 aa  51.2  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  25.73 
 
 
616 aa  51.2  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.46 
 
 
649 aa  50.8  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.79 
 
 
1343 aa  50.4  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.3 
 
 
479 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.94 
 
 
278 aa  50.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3429  hypothetical protein  21.77 
 
 
609 aa  50.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.59 
 
 
495 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3074  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.77 
 
 
612 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0393435  normal  0.650719 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1193  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.79 
 
 
275 aa  50.4  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4110  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  20.36 
 
 
729 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  24.12 
 
 
971 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.27 
 
 
554 aa  49.3  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.12 
 
 
971 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1503  diguanylate phosphodiesterase  26.83 
 
 
731 aa  49.7  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.293201  hitchhiker  0.000197979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0137  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.2 
 
 
915 aa  49.3  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.193132  normal  0.854443 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.4 
 
 
778 aa  49.3  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3027  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.57 
 
 
697 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.438464  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.7 
 
 
502 aa  49.3  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.5 
 
 
445 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6789  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.43 
 
 
1554 aa  48.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.92 
 
 
1240 aa  48.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  23.58 
 
 
654 aa  48.1  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3217  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.21 
 
 
531 aa  48.1  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.86766  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  23.39 
 
 
902 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>