More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3079 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  34.9 
 
 
1236 aa  660    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  52.92 
 
 
1686 aa  1795    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  53.25 
 
 
1711 aa  1808    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
1760 aa  3612    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  31.03 
 
 
1553 aa  629  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.62 
 
 
1481 aa  621  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  32.42 
 
 
1510 aa  614  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  39.02 
 
 
1163 aa  526  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  38.16 
 
 
1363 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  39.34 
 
 
1652 aa  523  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  41.31 
 
 
1789 aa  509  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  37.77 
 
 
1661 aa  505  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.31 
 
 
1240 aa  503  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.02 
 
 
1609 aa  499  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.07 
 
 
1583 aa  497  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.48 
 
 
1598 aa  491  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  30.98 
 
 
1714 aa  492  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  30.57 
 
 
1357 aa  485  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4542  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  49.62 
 
 
795 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4451  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  49.34 
 
 
795 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4110  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  47.57 
 
 
729 aa  464  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  37.29 
 
 
1656 aa  466  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.14 
 
 
1599 aa  456  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  36.92 
 
 
1523 aa  450  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.93 
 
 
1547 aa  442  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.91 
 
 
1626 aa  436  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  32.66 
 
 
1552 aa  435  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  35.77 
 
 
947 aa  430  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  39.61 
 
 
696 aa  429  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.34 
 
 
1684 aa  430  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  34.97 
 
 
1177 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  33.7 
 
 
1348 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  32.84 
 
 
1176 aa  415  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  35.66 
 
 
1454 aa  413  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  27.98 
 
 
1344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  37.03 
 
 
1858 aa  408  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 
1334 aa  398  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  38.64 
 
 
1221 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  39.96 
 
 
1364 aa  388  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.43 
 
 
1557 aa  385  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  34.47 
 
 
1868 aa  380  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.31 
 
 
1623 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  32.68 
 
 
1373 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  34.62 
 
 
1193 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.33 
 
 
1823 aa  371  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  37.74 
 
 
1196 aa  369  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  35.08 
 
 
1474 aa  364  1e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  26.74 
 
 
1657 aa  359  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  28.52 
 
 
1188 aa  359  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  32.48 
 
 
1367 aa  358  3.9999999999999996e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  34.58 
 
 
1190 aa  353  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.93 
 
 
1262 aa  352  4e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.78 
 
 
919 aa  352  5e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  35.74 
 
 
1443 aa  351  6e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  29.91 
 
 
1209 aa  348  6e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  30.19 
 
 
1016 aa  347  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  30.16 
 
 
1161 aa  345  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  30.07 
 
 
1016 aa  345  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  30.16 
 
 
1161 aa  345  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  29.87 
 
 
1831 aa  339  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  33.28 
 
 
1247 aa  335  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  26.68 
 
 
1401 aa  335  4e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  34.94 
 
 
1229 aa  327  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  29.83 
 
 
1213 aa  325  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  26.27 
 
 
1265 aa  323  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.73 
 
 
1607 aa  319  4e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.05 
 
 
930 aa  317  9e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  33.39 
 
 
1217 aa  311  5.9999999999999995e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  30.05 
 
 
1766 aa  306  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  30.06 
 
 
1208 aa  305  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  29.14 
 
 
1164 aa  301  9e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  28.93 
 
 
1901 aa  300  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.41 
 
 
1617 aa  294  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  31.64 
 
 
1304 aa  291  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  25.93 
 
 
1399 aa  285  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  40.25 
 
 
1599 aa  285  5.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  28.49 
 
 
1211 aa  285  7.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  26.79 
 
 
1264 aa  285  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  26.79 
 
 
1264 aa  285  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  25.12 
 
 
1699 aa  281  7e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.48 
 
 
1267 aa  279  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.87 
 
 
924 aa  278  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  26.55 
 
 
1807 aa  276  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  29.77 
 
 
608 aa  272  4e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  27.79 
 
 
1188 aa  268  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  38.96 
 
 
1878 aa  266  3e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  29.88 
 
 
728 aa  265  6e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  24.09 
 
 
1491 aa  263  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  25.99 
 
 
1190 aa  260  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  28.14 
 
 
1242 aa  260  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  29.51 
 
 
1416 aa  257  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  23.38 
 
 
1230 aa  256  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.17 
 
 
740 aa  254  9.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  46.24 
 
 
677 aa  254  9.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  29.81 
 
 
1279 aa  254  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  29.81 
 
 
1279 aa  254  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  27.81 
 
 
565 aa  253  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  29.71 
 
 
1411 aa  252  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  25.58 
 
 
1733 aa  250  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  26.39 
 
 
1209 aa  250  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>