More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3206 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 728 aa  1477    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  39.8 
 
 		 1523 aa  484  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  37.1 
 
 		 1454 aa  432  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  33.86 
 
 		 1416 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  35.22 
 
 		 1280 aa  405  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  38.45 
 
 		 1363 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  39.86 
 
 		 1236 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  36.63 
 
 		 1652 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  37.09 
 
 		 1868 aa  385  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  36.74 
 
 		 1163 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.75 
 
 		 1557 aa  365  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  35.78 
 
 		 1364 aa  358  1.9999999999999998e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  30.66 
 
 		 1484 aa  356  8.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  33.97 
 
 		 947 aa  351  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  34.54 
 
 		 696 aa  341  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  38.88 
 
 		 505 aa  340  5e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  34.62 
 
 		 1193 aa  334  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 1221 aa  325  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.75 
 
 		 1262 aa  319  1e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  34.42 
 
 		 1474 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.03 
 
 		 1607 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  31.05 
 
 		 1831 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  33.09 
 
 		 1247 aa  308  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  31.57 
 
 		 1188 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.27 
 
 		 1626 aa  305  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.04 
 
 		 1686 aa  304  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  30.29 
 
 		 1367 aa  303  9e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.76 
 
 		 1598 aa  301  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  33.88 
 
 		 1553 aa  301  3e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.19 
 
 		 1481 aa  298  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.39 
 
 		 1609 aa  296  9e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  35.75 
 
 		 1443 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  35.56 
 
 		 1789 aa  293  5e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.46 
 
 		 930 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.28 
 
 		 1583 aa  291  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  32.16 
 
 		 1190 aa  288  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.85 
 
 		 1547 aa  288  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  29.91 
 
 		 1229 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.85 
 
 		 1617 aa  284  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  36.23 
 
 		 1510 aa  280  5e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  30.7 
 
 		 1552 aa  277  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  30.27 
 
 		 1213 aa  276  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.16 
 
 		 1711 aa  275  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  33.22 
 
 		 1357 aa  274  5.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.54 
 
 		 1623 aa  273  6e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  30.87 
 
 		 1196 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.4 
 
 		 1760 aa  270  8e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.19 
 
 		 1599 aa  268  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.95 
 
 		 1684 aa  269  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  29.63 
 
 		 1807 aa  266  7e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  38.97 
 
 		 1656 aa  266  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.59 
 
 		 1267 aa  263  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  31.03 
 
 		 1211 aa  258  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.22 
 
 		 919 aa  258  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  32.74 
 
 		 1217 aa  258  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  29.74 
 
 		 1242 aa  248  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  30.26 
 
 		 1208 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  31.82 
 
 		 1661 aa  246  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  29.6 
 
 		 1161 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  29.6 
 
 		 1161 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.73 
 
 		 1856 aa  239  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  24.53 
 
 		 1901 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.09 
 
 		 1240 aa  231  5e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.57 
 
 		 1398 aa  229  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  31.87 
 
 		 1714 aa  225  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  29.07 
 
 		 1348 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  27.72 
 
 		 1330 aa  221  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.31 
 
 		 682 aa  219  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  29.05 
 
 		 1177 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.64 
 
 		 677 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  27.69 
 
 		 1491 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  30.03 
 
 		 1858 aa  217  7e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  25.91 
 
 		 1214 aa  216  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  24.9 
 
 		 1188 aa  213  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  30.76 
 
 		 1766 aa  213  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.02 
 
 		 924 aa  209  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  27.74 
 
 		 1176 aa  209  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  39.72 
 
 		 657 aa  206  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.38 
 
 		 676 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  24.06 
 
 		 1427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  27.3 
 
 		 1016 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  27.47 
 
 		 1016 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  38.03 
 
 		 589 aa  197  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.71 
 
 		 740 aa  197  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  38.91 
 
 		 778 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  35.9 
 
 		 1599 aa  196  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  33.92 
 
 		 1878 aa  194  6e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  29.32 
 
 		 1373 aa  194  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  25.09 
 
 		 565 aa  192  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  37.58 
 
 		 774 aa  192  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  36.88 
 
 		 687 aa  189  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  27.12 
 
 		 1164 aa  188  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  33.94 
 
 		 344 aa  188  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  25.72 
 
 		 1411 aa  187  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  28.45 
 
 		 1209 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  40.82 
 
 		 443 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  33.84 
 
 		 344 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  22.32 
 
 		 1209 aa  184  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.41 
 
 		 576 aa  183  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.48 
 
 		 664 aa  182  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>