More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3594 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  59.78 
 
 
1161 aa  1451    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  40.76 
 
 
1163 aa  832    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  39.01 
 
 
1190 aa  831    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  38.63 
 
 
1177 aa  778    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  38.7 
 
 
1176 aa  768    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  38.3 
 
 
1367 aa  776    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  59.78 
 
 
1161 aa  1451    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  100 
 
 
1164 aa  2390    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  36.1 
 
 
1209 aa  749    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  40.99 
 
 
891 aa  613  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  42.32 
 
 
1552 aa  550  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  40.42 
 
 
1789 aa  516  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  54.03 
 
 
902 aa  499  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  54.03 
 
 
902 aa  499  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  35.97 
 
 
1304 aa  440  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.5 
 
 
1711 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  46.51 
 
 
1477 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  35.64 
 
 
947 aa  416  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.52 
 
 
1686 aa  416  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  55.34 
 
 
781 aa  413  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  33.75 
 
 
1363 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  52.04 
 
 
1914 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.27 
 
 
1481 aa  399  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  34.89 
 
 
1553 aa  400  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  40.59 
 
 
1510 aa  387  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  51.53 
 
 
1908 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  36.69 
 
 
1714 aa  389  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  34.98 
 
 
1348 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  34.55 
 
 
1661 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  38.2 
 
 
1656 aa  386  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  33.23 
 
 
1652 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.71 
 
 
1557 aa  369  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 
2077 aa  360  8e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  33.8 
 
 
1831 aa  357  5e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  33.33 
 
 
1236 aa  355  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  47.7 
 
 
1932 aa  351  4e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  52.42 
 
 
335 aa  343  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.23 
 
 
1583 aa  332  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.23 
 
 
1684 aa  331  6e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  38.14 
 
 
1229 aa  330  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.97 
 
 
1760 aa  330  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  33.45 
 
 
1523 aa  327  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  32.87 
 
 
1766 aa  325  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  35.23 
 
 
1196 aa  325  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  35.09 
 
 
696 aa  323  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.03 
 
 
1626 aa  322  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.28 
 
 
1607 aa  317  9e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.28 
 
 
1598 aa  316  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.85 
 
 
1609 aa  314  6.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  35.64 
 
 
1364 aa  312  2e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.85 
 
 
1617 aa  310  6.999999999999999e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  33.05 
 
 
1454 aa  310  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  31.43 
 
 
1357 aa  310  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  31.67 
 
 
1858 aa  307  7e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.96 
 
 
1547 aa  304  7.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  33.88 
 
 
1221 aa  303  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  31.65 
 
 
1193 aa  303  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0228  putative Chase2 sensor protein  43.7 
 
 
787 aa  303  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.433927 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.37 
 
 
1599 aa  300  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  29.97 
 
 
1211 aa  298  5e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  30.95 
 
 
1190 aa  297  8e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  33.17 
 
 
1217 aa  297  8e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  27.71 
 
 
1373 aa  297  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  27.53 
 
 
1016 aa  297  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  27.29 
 
 
1016 aa  294  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.84 
 
 
1623 aa  290  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  29.9 
 
 
1901 aa  288  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  31.7 
 
 
1474 aa  286  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  31.33 
 
 
1264 aa  282  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  31.33 
 
 
1264 aa  282  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.53 
 
 
1868 aa  281  6e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  31.4 
 
 
1443 aa  278  6e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.94 
 
 
1262 aa  275  5.000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  38 
 
 
1599 aa  273  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  30.03 
 
 
1807 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  30.09 
 
 
1344 aa  266  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.04 
 
 
919 aa  265  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  30.97 
 
 
1247 aa  262  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  28.13 
 
 
1213 aa  261  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  43.21 
 
 
740 aa  252  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  29.12 
 
 
1188 aa  249  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.19 
 
 
1004 aa  249  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  30.63 
 
 
1491 aa  248  6e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  29.25 
 
 
1208 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.1 
 
 
930 aa  245  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.89 
 
 
924 aa  243  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  29.11 
 
 
1214 aa  242  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.75 
 
 
1856 aa  241  4e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.53 
 
 
1240 aa  239  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  25.13 
 
 
1279 aa  229  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  29.59 
 
 
1242 aa  226  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.6 
 
 
1823 aa  226  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  25.03 
 
 
1279 aa  226  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  30.24 
 
 
1280 aa  224  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  42.96 
 
 
344 aa  224  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.64 
 
 
1398 aa  224  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  29.3 
 
 
505 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  27.79 
 
 
1416 aa  224  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  26.97 
 
 
608 aa  222  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.65 
 
 
1267 aa  220  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>