More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_5032 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  35.99 
 
 
1209 aa  653    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  35.61 
 
 
1247 aa  641    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  40.76 
 
 
1193 aa  887    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  37.9 
 
 
1188 aa  804    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  36.54 
 
 
1208 aa  686    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  41.58 
 
 
1221 aa  861    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  47.58 
 
 
1196 aa  1084    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  36.88 
 
 
1213 aa  773    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
1190 aa  2427    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  30.5 
 
 
1188 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  31.9 
 
 
1411 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  40.11 
 
 
1474 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.62 
 
 
1557 aa  484  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  43.03 
 
 
696 aa  457  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  37.67 
 
 
1523 aa  451  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  40.49 
 
 
1652 aa  449  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  41.52 
 
 
1236 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  41.02 
 
 
1363 aa  449  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  40.68 
 
 
1443 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  40 
 
 
947 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  38.67 
 
 
1789 aa  432  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  39.22 
 
 
1163 aa  423  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.93 
 
 
1686 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  35.36 
 
 
1831 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  40.14 
 
 
1364 aa  399  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  36.52 
 
 
1454 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  37.62 
 
 
1552 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.14 
 
 
1711 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  35.91 
 
 
1553 aa  383  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  32.13 
 
 
1868 aa  379  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.3 
 
 
1481 aa  375  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  36.52 
 
 
1367 aa  373  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.31 
 
 
1609 aa  369  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  37.65 
 
 
1661 aa  366  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  36.18 
 
 
1510 aa  365  3e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.26 
 
 
1598 aa  362  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  36.99 
 
 
1357 aa  359  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  38.45 
 
 
919 aa  357  5.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.58 
 
 
1760 aa  353  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34 
 
 
1583 aa  347  6e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  33.33 
 
 
1901 aa  347  8.999999999999999e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  34.93 
 
 
1211 aa  344  5e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  38.11 
 
 
1714 aa  340  7e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  36.05 
 
 
1161 aa  338  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.01 
 
 
1626 aa  338  5e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  35.69 
 
 
1161 aa  337  5e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  35.73 
 
 
1348 aa  334  5e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.84 
 
 
1262 aa  334  5e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  37.38 
 
 
1656 aa  334  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.93 
 
 
1547 aa  329  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.9 
 
 
1607 aa  327  7e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  34.01 
 
 
1229 aa  326  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  34.15 
 
 
1176 aa  326  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.63 
 
 
930 aa  326  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  36.54 
 
 
1217 aa  325  3e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.62 
 
 
1599 aa  325  4e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  34.12 
 
 
1177 aa  311  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0937  WD repeat-containing protein  36.55 
 
 
566 aa  309  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  32.37 
 
 
1858 aa  304  7.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  29.92 
 
 
1807 aa  302  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.92 
 
 
1684 aa  302  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  30.95 
 
 
1164 aa  297  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  32.29 
 
 
1416 aa  295  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.34 
 
 
1623 aa  293  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.25 
 
 
1617 aa  292  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  32.16 
 
 
728 aa  288  4e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  33.01 
 
 
1344 aa  287  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  30.29 
 
 
1016 aa  283  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  32.03 
 
 
924 aa  281  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  30.15 
 
 
1016 aa  281  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.29 
 
 
1823 aa  279  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  32.21 
 
 
608 aa  277  9e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  30.58 
 
 
1766 aa  275  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.86 
 
 
1267 aa  274  9e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  29.13 
 
 
1214 aa  272  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.27 
 
 
1856 aa  268  5.999999999999999e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  29.99 
 
 
1330 aa  265  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  38.08 
 
 
1599 aa  265  3e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  33.16 
 
 
1280 aa  263  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  31.6 
 
 
1209 aa  263  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  29.46 
 
 
1304 aa  260  9e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4702  WD-40 repeat-containing protein  33.56 
 
 
464 aa  259  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  28.94 
 
 
1373 aa  259  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3256  transcriptional regulator, LuxR family  41.24 
 
 
438 aa  255  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.15 
 
 
1039 aa  252  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  30.95 
 
 
1264 aa  249  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  30.95 
 
 
1264 aa  249  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  30.05 
 
 
1190 aa  249  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  29.94 
 
 
1491 aa  249  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  29.95 
 
 
1334 aa  248  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  30.05 
 
 
1242 aa  247  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  33.16 
 
 
1041 aa  245  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  29.34 
 
 
1279 aa  244  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.43 
 
 
1240 aa  241  5.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  30.61 
 
 
1399 aa  241  6.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  32.34 
 
 
565 aa  240  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  29.21 
 
 
1279 aa  240  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  42.59 
 
 
740 aa  239  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  44.06 
 
 
676 aa  238  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  27.66 
 
 
505 aa  235  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>