More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4789 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  38.62 
 
 
1208 aa  828    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  43.03 
 
 
1188 aa  985    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  35.57 
 
 
1247 aa  699    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  100 
 
 
1193 aa  2447    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  41.49 
 
 
1221 aa  894    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  39.6 
 
 
1196 aa  853    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  39.3 
 
 
1213 aa  903    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  40.58 
 
 
1190 aa  877    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  35.47 
 
 
1209 aa  658    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  30.02 
 
 
1188 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  30.51 
 
 
1411 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  39.86 
 
 
1474 aa  558  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  41.73 
 
 
1443 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  43.96 
 
 
1652 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  41.31 
 
 
696 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  40.34 
 
 
1523 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  40.77 
 
 
1163 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  42.08 
 
 
1363 aa  486  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  41.06 
 
 
1831 aa  479  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  41.32 
 
 
1364 aa  474  1e-132  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  41.36 
 
 
1236 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.52 
 
 
1557 aa  475  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  39.21 
 
 
1454 aa  458  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  39.07 
 
 
947 aa  449  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  41.41 
 
 
1553 aa  442  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  40.28 
 
 
1789 aa  441  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.05 
 
 
1481 aa  441  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  40.55 
 
 
1510 aa  438  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.72 
 
 
1686 aa  435  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  35.99 
 
 
1868 aa  433  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  41.33 
 
 
1357 aa  412  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.23 
 
 
1711 aa  405  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  39.76 
 
 
919 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  41.18 
 
 
1217 aa  394  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  35.94 
 
 
1262 aa  382  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  35.09 
 
 
1901 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  40.51 
 
 
1661 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  35.83 
 
 
1367 aa  382  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  41.51 
 
 
1656 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  35.63 
 
 
1552 aa  375  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.62 
 
 
1760 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.7 
 
 
1598 aa  369  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  38.72 
 
 
1714 aa  364  6e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  36.08 
 
 
1211 aa  362  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  35.05 
 
 
1229 aa  362  3e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.78 
 
 
1609 aa  360  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  36.76 
 
 
1161 aa  357  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  36.6 
 
 
1161 aa  356  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.76 
 
 
1626 aa  356  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  35.1 
 
 
1176 aa  354  5e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  33.66 
 
 
1807 aa  354  5.9999999999999994e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.65 
 
 
1607 aa  346  2e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  35.2 
 
 
1177 aa  346  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.68 
 
 
930 aa  345  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.33 
 
 
1583 aa  345  2.9999999999999997e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  34.07 
 
 
1348 aa  338  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.63 
 
 
1599 aa  335  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.08 
 
 
1684 aa  334  6e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  34.24 
 
 
728 aa  334  7.000000000000001e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.85 
 
 
1547 aa  329  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0937  WD repeat-containing protein  33.45 
 
 
566 aa  323  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  35.17 
 
 
1858 aa  321  5e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.25 
 
 
1617 aa  321  5e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  34.55 
 
 
1766 aa  311  5e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  34.05 
 
 
1280 aa  310  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  33.77 
 
 
1416 aa  308  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  30.67 
 
 
1214 aa  304  5.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  31.65 
 
 
1164 aa  303  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.99 
 
 
1623 aa  302  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  33.8 
 
 
924 aa  301  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  33.96 
 
 
608 aa  295  3e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.76 
 
 
1267 aa  291  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.48 
 
 
1856 aa  286  1.0000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  40.27 
 
 
1878 aa  286  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  31.32 
 
 
1016 aa  286  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  29.36 
 
 
1242 aa  285  5.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  31.04 
 
 
1016 aa  285  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  32.88 
 
 
1264 aa  283  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  32.88 
 
 
1264 aa  283  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  30.78 
 
 
1344 aa  281  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  33.44 
 
 
1209 aa  281  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  29.23 
 
 
1399 aa  278  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  42.6 
 
 
344 aa  278  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  31.41 
 
 
505 aa  275  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  30.74 
 
 
1484 aa  273  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  36.81 
 
 
1599 aa  272  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  29.29 
 
 
1330 aa  271  5e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  30.63 
 
 
1190 aa  271  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  42.42 
 
 
740 aa  271  7e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  30.51 
 
 
1304 aa  270  8e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.42 
 
 
1823 aa  271  8e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  42.12 
 
 
344 aa  270  8.999999999999999e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  43.43 
 
 
676 aa  270  8.999999999999999e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  46.29 
 
 
677 aa  265  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  31.82 
 
 
1491 aa  262  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.2 
 
 
1039 aa  260  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  31.8 
 
 
1041 aa  259  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.28 
 
 
1004 aa  255  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  29.64 
 
 
1373 aa  255  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.73 
 
 
1240 aa  254  7e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>