More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4792 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  40.21 
 
 
1373 aa  952    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  100 
 
 
1363 aa  2819    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  46 
 
 
947 aa  786    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  48.25 
 
 
1656 aa  1137    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  57.1 
 
 
1163 aa  701    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  59.5 
 
 
1236 aa  821    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  48.75 
 
 
1652 aa  662    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  54.06 
 
 
1048 aa  765    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  51.35 
 
 
1348 aa  1385    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42.95 
 
 
1686 aa  600  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  43.44 
 
 
1523 aa  584  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  43.16 
 
 
1711 aa  578  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  46.38 
 
 
696 aa  576  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  51.6 
 
 
1443 aa  558  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  44.55 
 
 
1789 aa  552  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  48.36 
 
 
1221 aa  540  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  39.41 
 
 
1552 aa  538  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  51.42 
 
 
1364 aa  535  1e-150  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.16 
 
 
1760 aa  525  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  42.45 
 
 
1262 aa  518  1.0000000000000001e-145  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  46.86 
 
 
1553 aa  513  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  42.56 
 
 
1454 aa  513  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  47.04 
 
 
1557 aa  513  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  44.62 
 
 
1196 aa  511  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  46.01 
 
 
1868 aa  504  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  46.61 
 
 
1510 aa  503  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  46.34 
 
 
1481 aa  506  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  44.84 
 
 
1661 aa  503  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  42.93 
 
 
1474 aa  500  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  38.67 
 
 
1367 aa  496  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  42.08 
 
 
1193 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  34.3 
 
 
919 aa  484  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  41.65 
 
 
1188 aa  482  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  46.26 
 
 
1229 aa  478  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  36.83 
 
 
1357 aa  479  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  36.67 
 
 
1831 aa  474  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  41.22 
 
 
1714 aa  475  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.99 
 
 
1609 aa  455  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  39.83 
 
 
1247 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  41.02 
 
 
1190 aa  449  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.47 
 
 
1598 aa  445  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.77 
 
 
1607 aa  439  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  34.02 
 
 
1176 aa  440  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  35.96 
 
 
1901 aa  439  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  39.2 
 
 
1217 aa  436  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.4 
 
 
1599 aa  433  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.58 
 
 
1583 aa  436  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  40.03 
 
 
1547 aa  431  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  31.86 
 
 
1016 aa  426  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  31.86 
 
 
1016 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  35.33 
 
 
1213 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.88 
 
 
930 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  33.17 
 
 
1161 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  33.04 
 
 
1161 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.89 
 
 
1626 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  33.14 
 
 
1177 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  33.75 
 
 
1164 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  34.49 
 
 
1211 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  35.01 
 
 
1416 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  38.45 
 
 
728 aa  403  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  34.48 
 
 
1807 aa  387  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.08 
 
 
1684 aa  386  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  32.08 
 
 
1209 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.53 
 
 
1623 aa  383  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  34.32 
 
 
924 aa  383  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.78 
 
 
1617 aa  381  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  35.11 
 
 
1208 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  30.87 
 
 
1279 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  30.78 
 
 
1279 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  37.09 
 
 
1858 aa  372  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  34.65 
 
 
1242 aa  366  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  36.38 
 
 
1280 aa  362  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  35.38 
 
 
1188 aa  358  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  30.17 
 
 
1344 aa  357  5.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.25 
 
 
1856 aa  352  2e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.44 
 
 
1267 aa  353  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  45.94 
 
 
1599 aa  343  1e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  31.92 
 
 
1264 aa  341  5e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  31.92 
 
 
1264 aa  341  5e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  32.2 
 
 
1304 aa  340  8e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  35.54 
 
 
1491 aa  335  5e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  34.18 
 
 
608 aa  333  1e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  30.08 
 
 
1214 aa  333  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  33.39 
 
 
1766 aa  332  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  58.5 
 
 
676 aa  330  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  42.68 
 
 
1878 aa  327  6e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  31.37 
 
 
1330 aa  326  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  35.41 
 
 
1411 aa  323  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  50.91 
 
 
344 aa  323  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  38.03 
 
 
505 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  37.19 
 
 
1311 aa  320  1e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.38 
 
 
1240 aa  317  9e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  51.06 
 
 
344 aa  317  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  32.79 
 
 
1041 aa  316  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  42.9 
 
 
1398 aa  315  4.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  29.01 
 
 
1190 aa  311  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.82 
 
 
1039 aa  304  7.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.6 
 
 
1823 aa  303  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  29.41 
 
 
1484 aa  302  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  29.45 
 
 
1334 aa  300  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>