More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3599 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 1211 aa  2432    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  51.16 
 
 		 1557 aa  557  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  35.02 
 
 		 1217 aa  557  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  44.85 
 
 		 1357 aa  549  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  41.33 
 
 		 919 aa  532  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  30.3 
 
 		 1229 aa  450  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  32.88 
 
 		 1652 aa  433  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  34.25 
 
 		 1363 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.65 
 
 		 1481 aa  424  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  44.14 
 
 		 696 aa  420  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  42.7 
 
 		 1523 aa  422  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  38.12 
 
 		 1510 aa  419  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  44.43 
 
 		 1454 aa  415  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.55 
 
 		 1598 aa  416  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  34.28 
 
 		 1163 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.25 
 
 		 1583 aa  405  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  39.55 
 
 		 1868 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  35.99 
 
 		 947 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 1221 aa  392  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  33.66 
 
 		 1553 aa  389  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.15 
 
 		 1626 aa  385  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  39.2 
 
 		 1236 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  29.32 
 
 		 1552 aa  385  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  37.16 
 
 		 924 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  38.26 
 
 		 1188 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  37.86 
 
 		 1474 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.1 
 
 		 1547 aa  372  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  33.37 
 
 		 1399 aa  372  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  38.95 
 
 		 1364 aa  370  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  36.24 
 
 		 1196 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  34.43 
 
 		 1367 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  36.08 
 
 		 1193 aa  363  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.35 
 
 		 1684 aa  362  3e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  40.44 
 
 		 1609 aa  360  7e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  33.6 
 
 		 1789 aa  358  2.9999999999999997e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  40.26 
 
 		 1607 aa  355  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  30.07 
 
 		 1831 aa  352  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  34.93 
 
 		 1190 aa  345  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  37.26 
 
 		 1443 aa  343  9e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.38 
 
 		 1686 aa  340  8e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.03 
 
 		 1711 aa  339  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.59 
 
 		 1262 aa  338  2.9999999999999997e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  28.08 
 
 		 1661 aa  333  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  35.97 
 
 		 1491 aa  332  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  35.54 
 
 		 1344 aa  330  8e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.33 
 
 		 1623 aa  328  4.0000000000000003e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  27.98 
 
 		 1714 aa  328  4.0000000000000003e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.37 
 
 		 1599 aa  323  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  36.13 
 
 		 1656 aa  322  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  55.02 
 
 		 1240 aa  321  6e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.23 
 
 		 1617 aa  318  4e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  33.62 
 
 		 1247 aa  318  5e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  29.72 
 
 		 1161 aa  311  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  29.72 
 
 		 1161 aa  311  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.65 
 
 		 930 aa  306  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  35.97 
 
 		 1416 aa  304  8.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  32.88 
 
 		 1242 aa  302  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  29.99 
 
 		 1164 aa  301  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  32.12 
 
 		 1213 aa  301  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  35.05 
 
 		 1901 aa  296  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  33.19 
 
 		 1214 aa  296  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  42.27 
 
 		 1267 aa  286  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.49 
 
 		 1760 aa  285  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  38.09 
 
 		 1280 aa  283  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  37.47 
 
 		 1807 aa  283  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  26.91 
 
 		 1183 aa  282  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  30.87 
 
 		 1411 aa  280  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  32.73 
 
 		 1176 aa  278  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  27.59 
 
 		 1334 aa  278  6e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  30.56 
 
 		 1208 aa  277  8e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  30.37 
 
 		 1348 aa  274  9e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  30.65 
 
 		 1858 aa  268  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.77 
 
 		 1856 aa  266  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  33.97 
 
 		 505 aa  266  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  30.19 
 
 		 1177 aa  261  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  34.85 
 
 		 1766 aa  259  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  31.03 
 
 		 728 aa  258  4e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  34.52 
 
 		 1484 aa  257  9e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  32.06 
 
 		 1311 aa  256  1.0000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  43.93 
 
 		 1398 aa  255  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1253  WD-40 repeat protein  24.67 
 
 		 960 aa  253  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  28.42 
 
 		 1304 aa  252  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  46.34 
 
 		 675 aa  249  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  28.32 
 
 		 1188 aa  248  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  30.74 
 
 		 1209 aa  242  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  33.39 
 
 		 1100 aa  241  5e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  30.45 
 
 		 1330 aa  239  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  37.06 
 
 		 1878 aa  236  3e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  27.7 
 
 		 1016 aa  234  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  32.08 
 
 		 608 aa  233  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  39.36 
 
 		 1599 aa  230  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.13 
 
 		 1823 aa  228  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  29.85 
 
 		 1373 aa  226  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  27.86 
 
 		 1016 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.94 
 
 		 740 aa  221  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  39.82 
 
 		 344 aa  219  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  39.21 
 
 		 344 aa  218  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1657 aa  218  5e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.69 
 
 		 1205 aa  218  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  24.19 
 
 		 1264 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>