More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4184 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  43.24 
 
 		 1401 aa  719    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  45.35 
 
 		 1265 aa  895    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  37.12 
 
 		 1334 aa  653    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  100 
 
 		 1657 aa  3220    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  36.8 
 
 		 1344 aa  636  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  29.53 
 
 		 1553 aa  465  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.61 
 
 		 1711 aa  451  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  30.09 
 
 		 1510 aa  452  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.63 
 
 		 1481 aa  439  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  30.97 
 
 		 1230 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  34.33 
 
 		 1357 aa  430  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.28 
 
 		 1686 aa  426  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.59 
 
 		 1236 aa  417  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.84 
 
 		 1760 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.99 
 
 		 1240 aa  389  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3798  WD40 repeat, subgroup  29.1 
 
 		 1301 aa  364  6e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1793  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 901 aa  364  6e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.03808  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  37.24 
 
 		 919 aa  362  4e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  30.44 
 
 		 1699 aa  333  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  28.99 
 
 		 1733 aa  331  7e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.15 
 
 		 1583 aa  319  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.19 
 
 		 1598 aa  318  4e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  28.54 
 
 		 1363 aa  308  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.88 
 
 		 1609 aa  299  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.43 
 
 		 1684 aa  296  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  26.91 
 
 		 947 aa  290  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  28.65 
 
 		 1163 aa  288  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  29.11 
 
 		 1355 aa  287  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.32 
 
 		 1547 aa  285  7.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.46 
 
 		 1617 aa  275  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.55 
 
 		 1599 aa  275  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  37.57 
 
 		 696 aa  275  6e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  27.24 
 
 		 1491 aa  273  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 1221 aa  269  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.03 
 
 		 1626 aa  266  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  28.61 
 
 		 1652 aa  266  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.41 
 
 		 1256 aa  266  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  31.94 
 
 		 1523 aa  264  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  30.4 
 
 		 1196 aa  258  6e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.39 
 
 		 1823 aa  253  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  30.24 
 
 		 1247 aa  249  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  30.2 
 
 		 1188 aa  248  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  30.29 
 
 		 1193 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  28.62 
 
 		 1656 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.2 
 
 		 1557 aa  246  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  31.35 
 
 		 1364 aa  236  3e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  29.67 
 
 		 1789 aa  236  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.56 
 
 		 1398 aa  231  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  27.9 
 
 		 1211 aa  229  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  33.69 
 
 		 1152 aa  227  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.83 
 
 		 1262 aa  223  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  31.39 
 
 		 1443 aa  220  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.91 
 
 		 930 aa  220  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  35.17 
 
 		 885 aa  220  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.67 
 
 		 1868 aa  219  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  27.65 
 
 		 1176 aa  218  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  32.77 
 
 		 924 aa  217  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  25.03 
 
 		 1348 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  30.31 
 
 		 1190 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  35.59 
 
 		 1217 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  34.12 
 
 		 1157 aa  214  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  28.1 
 
 		 1474 aa  212  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  29.58 
 
 		 1454 aa  209  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  28.53 
 
 		 1831 aa  208  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  26.51 
 
 		 1399 aa  207  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1024  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1026 aa  207  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000341432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  28.01 
 
 		 1552 aa  206  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3444  WD-40 repeat protein  27.17 
 
 		 1308 aa  206  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  28.85 
 
 		 1661 aa  205  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.1 
 
 		 737 aa  204  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  26.2 
 
 		 1177 aa  202  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  30.78 
 
 		 1901 aa  202  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.21 
 
 		 865 aa  201  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  29.11 
 
 		 1229 aa  200  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  23.77 
 
 		 1714 aa  200  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  24.19 
 
 		 1164 aa  200  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  26.26 
 
 		 1213 aa  200  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.16 
 
 		 828 aa  198  7e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  27.68 
 
 		 1367 aa  194  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  28.6 
 
 		 1073 aa  193  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  28.6 
 
 		 902 aa  193  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  25.31 
 
 		 1208 aa  192  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  25.31 
 
 		 1188 aa  191  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2761  WD-40 repeat-containing protein  27.51 
 
 		 1117 aa  189  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645221  normal  0.818272 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  27.44 
 
 		 1209 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  24.67 
 
 		 1161 aa  187  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  24.67 
 
 		 1161 aa  185  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  29.47 
 
 		 1416 aa  183  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.2 
 
 		 833 aa  183  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  32.08 
 
 		 972 aa  182  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  25.61 
 
 		 1330 aa  181  9e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  24.65 
 
 		 1016 aa  180  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.81 
 
 		 1190 aa  180  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  24.54 
 
 		 1016 aa  178  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  25 
 
 		 505 aa  174  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  29.31 
 
 		 1484 aa  174  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  30.51 
 
 		 1766 aa  173  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0276  WD-40 repeat-containing protein  28.44 
 
 		 994 aa  172  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.08 
 
 		 1267 aa  171  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7111  Serine/threonine protein kinase-like protein  28.72 
 
 		 1194 aa  170  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0520138  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>