More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0575 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  100 
 
 		 1856 aa  3785    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  32.46 
 
 		 1454 aa  428  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  34.5 
 
 		 1523 aa  423  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  36.06 
 
 		 1367 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  33.47 
 
 		 1229 aa  361  7e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  36.05 
 
 		 1553 aa  356  2.9999999999999997e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  33.84 
 
 		 1363 aa  343  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  35.55 
 
 		 1510 aa  339  2.9999999999999997e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  33.07 
 
 		 1236 aa  330  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  31 
 
 		 1831 aa  323  3e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  30.46 
 
 		 1868 aa  320  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.47 
 
 		 1481 aa  320  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  33.56 
 
 		 1163 aa  319  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  30.91 
 
 		 1652 aa  315  5.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  31.81 
 
 		 947 aa  310  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  35.08 
 
 		 696 aa  306  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.54 
 
 		 1557 aa  304  9e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  33.17 
 
 		 1552 aa  294  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  34.4 
 
 		 1364 aa  288  1.0000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.13 
 
 		 1686 aa  287  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  31.48 
 
 		 1193 aa  286  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.07 
 
 		 1262 aa  285  4.0000000000000003e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.19 
 
 		 1684 aa  283  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  33.44 
 
 		 1789 aa  279  4e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  33.9 
 
 		 1357 aa  275  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  32.15 
 
 		 1656 aa  274  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  31.42 
 
 		 1196 aa  271  7e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 1221 aa  270  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  29.09 
 
 		 1474 aa  270  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  30.27 
 
 		 1190 aa  268  8e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  30.74 
 
 		 1188 aa  266  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  32.77 
 
 		 1211 aa  266  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  30.54 
 
 		 1901 aa  265  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  30.1 
 
 		 1807 aa  264  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  27.71 
 
 		 1858 aa  261  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  32.15 
 
 		 919 aa  260  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1711  serine/threonine protein kinase  40.53 
 
 		 1043 aa  260  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.610631  normal  0.122083 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  32.84 
 
 		 1217 aa  259  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.8 
 
 		 1583 aa  258  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.55 
 
 		 1598 aa  254  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.8 
 
 		 1609 aa  254  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.88 
 
 		 1626 aa  253  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  30.2 
 
 		 1214 aa  253  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.45 
 
 		 1607 aa  252  6e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.44 
 
 		 1547 aa  251  7e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.92 
 
 		 1599 aa  251  8e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.13 
 
 		 1623 aa  249  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.8 
 
 		 930 aa  248  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  30 
 
 		 1443 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.61 
 
 		 1711 aa  244  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  29.7 
 
 		 1247 aa  243  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  30.73 
 
 		 728 aa  240  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  27.99 
 
 		 1242 aa  239  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  31.19 
 
 		 1491 aa  238  7e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.63 
 
 		 1617 aa  236  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  27.52 
 
 		 1208 aa  233  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  28.12 
 
 		 1161 aa  231  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  27.96 
 
 		 1161 aa  230  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  26.72 
 
 		 1213 aa  229  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.33 
 
 		 1760 aa  226  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  30.12 
 
 		 1176 aa  225  7e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  32.52 
 
 		 1766 aa  224  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  29.16 
 
 		 1661 aa  223  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  29.95 
 
 		 1348 aa  221  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  26.62 
 
 		 1330 aa  219  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.86 
 
 		 924 aa  218  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  29.48 
 
 		 1177 aa  216  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  29.48 
 
 		 1714 aa  215  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  28.02 
 
 		 1164 aa  214  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  28.77 
 
 		 1416 aa  214  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  30.78 
 
 		 1344 aa  212  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.15 
 
 		 1823 aa  210  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.33 
 
 		 1267 aa  210  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  24.34 
 
 		 1188 aa  207  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  29.67 
 
 		 1280 aa  207  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.23 
 
 		 740 aa  204  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  29.64 
 
 		 1304 aa  203  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  27.29 
 
 		 505 aa  201  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6667  serine/threonine protein kinase  33.7 
 
 		 651 aa  199  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  26.83 
 
 		 1264 aa  197  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  26.83 
 
 		 1264 aa  197  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.48 
 
 		 1398 aa  195  8e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  25.99 
 
 		 1373 aa  194  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.01 
 
 		 1240 aa  191  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  24.65 
 
 		 1016 aa  191  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  24.37 
 
 		 1016 aa  189  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  28.75 
 
 		 1484 aa  189  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  29.3 
 
 		 1399 aa  189  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  26.69 
 
 		 1411 aa  186  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  32.61 
 
 		 1100 aa  184  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  36.53 
 
 		 344 aa  184  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  35.23 
 
 		 657 aa  183  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.89 
 
 		 677 aa  182  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  30.24 
 
 		 1878 aa  182  7e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  36.23 
 
 		 344 aa  179  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  37.62 
 
 		 842 aa  178  8e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  32.39 
 
 		 1599 aa  178  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  27.85 
 
 		 608 aa  177  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  26.52 
 
 		 1183 aa  176  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  25.64 
 
 		 1190 aa  176  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>