More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1556 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  37.06 
 
 		 1599 aa  869    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  36.24 
 
 		 1858 aa  783    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  40.5 
 
 		 1789 aa  1137    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  45.71 
 
 		 1363 aa  664    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  100 
 
 		 1652 aa  3378    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  39.64 
 
 		 1661 aa  1022    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  38.07 
 
 		 1552 aa  1089    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  36.36 
 
 		 1714 aa  964    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  45.92 
 
 		 1163 aa  638    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  33.39 
 
 		 1236 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  44.05 
 
 		 1523 aa  599  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  43.84 
 
 		 947 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  45.11 
 
 		 1831 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.13 
 
 		 1686 aa  582  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  47.83 
 
 		 696 aa  577  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  51.6 
 
 		 1364 aa  568  1e-160  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.51 
 
 		 1760 aa  544  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  48.67 
 
 		 1443 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.79 
 
 		 1711 aa  535  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 1221 aa  533  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  45.23 
 
 		 1481 aa  528  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  43.96 
 
 		 1193 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  44.46 
 
 		 1474 aa  525  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  40.44 
 
 		 1454 aa  525  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  46.01 
 
 		 1510 aa  520  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  41.16 
 
 		 1357 aa  521  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.28 
 
 		 1557 aa  520  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  44.54 
 
 		 1553 aa  513  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  40.51 
 
 		 1196 aa  513  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  42.64 
 
 		 1188 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  41.21 
 
 		 1868 aa  500  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  51.91 
 
 		 1656 aa  489  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  39.44 
 
 		 1262 aa  473  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  39.07 
 
 		 919 aa  470  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1229 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  37.15 
 
 		 1367 aa  456  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  40.49 
 
 		 1190 aa  450  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  41.7 
 
 		 1247 aa  450  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  33.5 
 
 		 1211 aa  441  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.75 
 
 		 1598 aa  432  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  37.68 
 
 		 1217 aa  432  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  37.5 
 
 		 1177 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.88 
 
 		 1607 aa  425  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  33.78 
 
 		 1901 aa  422  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.24 
 
 		 1609 aa  419  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.79 
 
 		 1583 aa  417  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  36.93 
 
 		 1213 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.31 
 
 		 1626 aa  415  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.26 
 
 		 1547 aa  413  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  34.13 
 
 		 1807 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  31.8 
 
 		 1161 aa  410  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  31.8 
 
 		 1161 aa  410  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  35.68 
 
 		 1416 aa  406  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.81 
 
 		 930 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  36.02 
 
 		 1176 aa  402  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  36.63 
 
 		 728 aa  398  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.6 
 
 		 1617 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  35.17 
 
 		 1208 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  35.61 
 
 		 1348 aa  396  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.71 
 
 		 1599 aa  392  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.27 
 
 		 1684 aa  380  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  31.85 
 
 		 1188 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  30.77 
 
 		 1164 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  35.36 
 
 		 1373 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  36.43 
 
 		 1280 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  32.74 
 
 		 1344 aa  363  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.34 
 
 		 1267 aa  355  2.9999999999999997e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  31.38 
 
 		 1242 aa  355  4e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  35.28 
 
 		 1304 aa  351  7e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.45 
 
 		 1623 aa  351  8e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  32.13 
 
 		 1016 aa  350  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  32.01 
 
 		 1016 aa  349  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  32.72 
 
 		 924 aa  350  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  33.45 
 
 		 1766 aa  346  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  31.05 
 
 		 1484 aa  342  4e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  31.55 
 
 		 1209 aa  338  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  35.14 
 
 		 1311 aa  338  5e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  35.74 
 
 		 1411 aa  333  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.98 
 
 		 1823 aa  329  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  32.04 
 
 		 1491 aa  325  4e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  29.41 
 
 		 1214 aa  325  5e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  32.17 
 
 		 1209 aa  321  6e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42.35 
 
 		 1240 aa  319  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  43.92 
 
 		 1878 aa  319  3e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  37.61 
 
 		 505 aa  318  4e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  44.85 
 
 		 344 aa  318  5e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  28.88 
 
 		 1190 aa  316  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  45.15 
 
 		 344 aa  316  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  33.05 
 
 		 608 aa  315  6.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  26.77 
 
 		 1183 aa  315  6.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.91 
 
 		 1856 aa  314  1e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  30.86 
 
 		 1330 aa  309  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  49.31 
 
 		 676 aa  303  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  45.39 
 
 		 677 aa  299  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  32.01 
 
 		 1041 aa  296  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  28.97 
 
 		 1264 aa  290  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  28.97 
 
 		 1264 aa  290  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.78 
 
 		 1039 aa  289  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.95 
 
 		 1205 aa  288  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  43.75 
 
 		 740 aa  288  9e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>