More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0315 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  47.51 
 
 		 919 aa  753    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  100 
 
 		 924 aa  1812    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  41.31 
 
 		 1357 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  44.01 
 
 		 1217 aa  432  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  38.89 
 
 		 1510 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.99 
 
 		 1481 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  34.71 
 
 		 1163 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  38.89 
 
 		 1553 aa  394  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  34.93 
 
 		 1211 aa  389  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  34 
 
 		 1363 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  35.29 
 
 		 1229 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  43.79 
 
 		 696 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  39.17 
 
 		 1367 aa  369  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.35 
 
 		 1557 aa  365  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 1221 aa  354  4e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  32.72 
 
 		 1652 aa  351  5e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  31.29 
 
 		 947 aa  347  7e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  35.38 
 
 		 1789 aa  345  2e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  32.98 
 
 		 943 aa  342  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  37.46 
 
 		 1831 aa  340  8e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  35.2 
 
 		 1552 aa  340  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  36.68 
 
 		 1523 aa  333  6e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  38.42 
 
 		 1344 aa  332  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  32.02 
 
 		 1236 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.08 
 
 		 1686 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  34.68 
 
 		 1196 aa  319  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  35.7 
 
 		 1364 aa  318  4e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  33.8 
 
 		 1193 aa  302  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  37.09 
 
 		 1901 aa  301  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  32.65 
 
 		 1656 aa  300  9e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  30.68 
 
 		 1868 aa  299  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  34.62 
 
 		 1491 aa  299  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  29.88 
 
 		 1161 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  35.14 
 
 		 1443 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  33.28 
 
 		 1304 aa  295  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.01 
 
 		 1684 aa  295  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  29.88 
 
 		 1161 aa  294  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.93 
 
 		 1711 aa  293  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  35.91 
 
 		 1454 aa  290  7e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.64 
 
 		 1262 aa  288  5e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  31.48 
 
 		 1188 aa  283  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  32.03 
 
 		 1190 aa  282  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.87 
 
 		 1760 aa  280  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  35.08 
 
 		 1661 aa  272  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  32.97 
 
 		 1474 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1399 aa  271  5e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  30.03 
 
 		 1213 aa  271  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.16 
 
 		 1598 aa  270  7e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.23 
 
 		 1609 aa  270  8e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.49 
 
 		 1583 aa  269  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.65 
 
 		 1623 aa  268  5e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  30.72 
 
 		 1247 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.02 
 
 		 1599 aa  266  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  30.97 
 
 		 1334 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.57 
 
 		 1607 aa  264  4.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.49 
 
 		 1626 aa  262  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.93 
 
 		 1547 aa  263  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  36.23 
 
 		 1807 aa  259  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  30.32 
 
 		 1208 aa  258  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  31.08 
 
 		 1348 aa  257  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36 
 
 		 1617 aa  257  7e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  36.89 
 
 		 1766 aa  254  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.33 
 
 		 930 aa  249  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  30.05 
 
 		 1714 aa  249  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  35.1 
 
 		 1280 aa  244  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  30.89 
 
 		 1164 aa  244  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  48.68 
 
 		 675 aa  240  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  27.06 
 
 		 1858 aa  239  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  34.59 
 
 		 1183 aa  238  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  27.1 
 
 		 1264 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  27.1 
 
 		 1264 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  44.67 
 
 		 344 aa  235  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.34 
 
 		 1856 aa  233  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.36 
 
 		 1240 aa  233  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  32.66 
 
 		 1416 aa  233  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  29.53 
 
 		 1311 aa  231  4e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  44.09 
 
 		 344 aa  231  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  33.86 
 
 		 1214 aa  229  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  29.43 
 
 		 1188 aa  229  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  29.87 
 
 		 1190 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  28.19 
 
 		 1411 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  33.76 
 
 		 1100 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  44.71 
 
 		 740 aa  226  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  28.75 
 
 		 1177 aa  224  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  28.99 
 
 		 1209 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  28.53 
 
 		 1176 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.86 
 
 		 1267 aa  222  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  31.35 
 
 		 608 aa  221  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  30.4 
 
 		 1242 aa  219  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  32.77 
 
 		 1657 aa  219  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  31.19 
 
 		 1477 aa  216  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.74 
 
 		 1823 aa  214  5.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  31.74 
 
 		 1484 aa  211  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  33.89 
 
 		 1599 aa  209  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  26.02 
 
 		 728 aa  209  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  43.59 
 
 		 737 aa  206  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  26.2 
 
 		 505 aa  205  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  25.93 
 
 		 1016 aa  205  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  44.76 
 
 		 642 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  25.78 
 
 		 1016 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>